Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR8

D13Ertd608e, D13Ertd608e protein, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D13Ertd608eQ3UPR8 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
D13Ertd608eQ3UPR8 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
D13Ertd608eQ3UPR8 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
D13Ertd608eQ3UPR8 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
D13Ertd608eQ3UPR8 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
D13Ertd608eQ3UPR8 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
D13Ertd608eQ3UPR8 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
D13Ertd608eQ3UPR8 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
D13Ertd608eQ3UPR8 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
D13Ertd608eQ3UPR8 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
D13Ertd608eQ3UPR8 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
D13Ertd608eQ3UPR8 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
D13Ertd608eQ3UPR8 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
D13Ertd608eQ3UPR8 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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D13Ertd608eQ3UPR8 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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D13Ertd608eQ3UPR8 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
D13Ertd608eQ3UPR8 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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D13Ertd608eQ3UPR8 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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D13Ertd608eQ3UPR8 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
D13Ertd608eQ3UPR8 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
D13Ertd608eQ3UPR8 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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D13Ertd608eQ3UPR8 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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D13Ertd608eQ3UPR8 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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D13Ertd608eQ3UPR8 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
D13Ertd608eQ3UPR8 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
D13Ertd608eQ3UPR8 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
D13Ertd608eQ3UPR8 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
D13Ertd608eQ3UPR8 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
D13Ertd608eQ3UPR8 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
D13Ertd608eQ3UPR8 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
D13Ertd608eQ3UPR8 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
D13Ertd608eQ3UPR8 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
D13Ertd608eQ3UPR8 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
D13Ertd608eQ3UPR8 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
D13Ertd608eQ3UPR8 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
D13Ertd608eQ3UPR8 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
D13Ertd608eQ3UPR8 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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D13Ertd608eQ3UPR8 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
D13Ertd608eQ3UPR8 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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D13Ertd608eQ3UPR8 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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