Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPL0

Sec31a, Protein transport protein Sec31A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec31aQ3UPL0 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sec31aQ3UPL0 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sec31aQ3UPL0 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Sec31aQ3UPL0 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sec31aQ3UPL0 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sec31aQ3UPL0 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sec31aQ3UPL0 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sec31aQ3UPL0 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Sec31aQ3UPL0 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sec31aQ3UPL0 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sec31aQ3UPL0 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sec31aQ3UPL0 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sec31aQ3UPL0 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sec31aQ3UPL0 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sec31aQ3UPL0 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sec31aQ3UPL0 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sec31aQ3UPL0 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sec31aQ3UPL0 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sec31aQ3UPL0 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sec31aQ3UPL0 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sec31aQ3UPL0 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sec31aQ3UPL0 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sec31aQ3UPL0 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sec31aQ3UPL0 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sec31aQ3UPL0 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sec31aQ3UPL0 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Sec31aQ3UPL0 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sec31aQ3UPL0 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sec31aQ3UPL0 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sec31aQ3UPL0 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sec31aQ3UPL0 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sec31aQ3UPL0 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sec31aQ3UPL0 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sec31aQ3UPL0 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sec31aQ3UPL0 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sec31aQ3UPL0 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sec31aQ3UPL0 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sec31aQ3UPL0 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sec31aQ3UPL0 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sec31aQ3UPL0 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sec31aQ3UPL0 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sec31aQ3UPL0 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sec31aQ3UPL0 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sec31aQ3UPL0 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sec31aQ3UPL0 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sec31aQ3UPL0 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sec31aQ3UPL0 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sec31aQ3UPL0 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sec31aQ3UPL0 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sec31aQ3UPL0 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sec31aQ3UPL0 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sec31aQ3UPL0 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sec31aQ3UPL0 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sec31aQ3UPL0 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sec31aQ3UPL0 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sec31aQ3UPL0 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sec31aQ3UPL0 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sec31aQ3UPL0 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sec31aQ3UPL0 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sec31aQ3UPL0 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sec31aQ3UPL0 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sec31aQ3UPL0 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sec31aQ3UPL0 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sec31aQ3UPL0 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sec31aQ3UPL0 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sec31aQ3UPL0 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sec31aQ3UPL0 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sec31aQ3UPL0 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sec31aQ3UPL0 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sec31aQ3UPL0 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sec31aQ3UPL0 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sec31aQ3UPL0 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sec31aQ3UPL0 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sec31aQ3UPL0 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sec31aQ3UPL0 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sec31aQ3UPL0 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sec31aQ3UPL0 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sec31aQ3UPL0 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sec31aQ3UPL0 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sec31aQ3UPL0 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sec31aQ3UPL0 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sec31aQ3UPL0 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sec31aQ3UPL0 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sec31aQ3UPL0 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sec31aQ3UPL0 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sec31aQ3UPL0 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sec31aQ3UPL0 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sec31aQ3UPL0 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sec31aQ3UPL0 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sec31aQ3UPL0 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sec31aQ3UPL0 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sec31aQ3UPL0 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sec31aQ3UPL0 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sec31aQ3UPL0 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sec31aQ3UPL0 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sec31aQ3UPL0 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sec31aQ3UPL0 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sec31aQ3UPL0 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sec31aQ3UPL0 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sec31aQ3UPL0 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms