Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMU9

Hdgfl2, Hepatoma-derived growth factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl2Q3UMU9 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Hdgfl2Q3UMU9 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hdgfl2Q3UMU9 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hdgfl2Q3UMU9 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Hdgfl2Q3UMU9 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hdgfl2Q3UMU9 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Hdgfl2Q3UMU9 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Hdgfl2Q3UMU9 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hdgfl2Q3UMU9 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Hdgfl2Q3UMU9 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Hdgfl2Q3UMU9 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Hdgfl2Q3UMU9 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hdgfl2Q3UMU9 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hdgfl2Q3UMU9 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Hdgfl2Q3UMU9 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Hdgfl2Q3UMU9 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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