Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW6

Ccdc33, Coiled-coil domain-containing protein 33, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc33Q3ULW6 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc33Q3ULW6 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc33Q3ULW6 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc33Q3ULW6 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc33Q3ULW6 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc33Q3ULW6 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc33Q3ULW6 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc33Q3ULW6 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc33Q3ULW6 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc33Q3ULW6 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc33Q3ULW6 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc33Q3ULW6 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc33Q3ULW6 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc33Q3ULW6 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc33Q3ULW6 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc33Q3ULW6 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc33Q3ULW6 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc33Q3ULW6 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc33Q3ULW6 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc33Q3ULW6 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc33Q3ULW6 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc33Q3ULW6 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc33Q3ULW6 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc33Q3ULW6 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc33Q3ULW6 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc33Q3ULW6 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc33Q3ULW6 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc33Q3ULW6 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc33Q3ULW6 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc33Q3ULW6 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc33Q3ULW6 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc33Q3ULW6 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc33Q3ULW6 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc33Q3ULW6 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc33Q3ULW6 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc33Q3ULW6 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc33Q3ULW6 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc33Q3ULW6 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc33Q3ULW6 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc33Q3ULW6 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc33Q3ULW6 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc33Q3ULW6 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc33Q3ULW6 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc33Q3ULW6 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc33Q3ULW6 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc33Q3ULW6 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc33Q3ULW6 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc33Q3ULW6 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc33Q3ULW6 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc33Q3ULW6 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc33Q3ULW6 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc33Q3ULW6 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc33Q3ULW6 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc33Q3ULW6 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc33Q3ULW6 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc33Q3ULW6 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc33Q3ULW6 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc33Q3ULW6 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc33Q3ULW6 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc33Q3ULW6 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc33Q3ULW6 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc33Q3ULW6 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc33Q3ULW6 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc33Q3ULW6 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc33Q3ULW6 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc33Q3ULW6 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc33Q3ULW6 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc33Q3ULW6 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc33Q3ULW6 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc33Q3ULW6 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc33Q3ULW6 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc33Q3ULW6 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc33Q3ULW6 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc33Q3ULW6 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc33Q3ULW6 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc33Q3ULW6 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc33Q3ULW6 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc33Q3ULW6 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc33Q3ULW6 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc33Q3ULW6 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc33Q3ULW6 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc33Q3ULW6 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc33Q3ULW6 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc33Q3ULW6 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccdc33Q3ULW6 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccdc33Q3ULW6 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccdc33Q3ULW6 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccdc33Q3ULW6 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc33Q3ULW6 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc33Q3ULW6 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc33Q3ULW6 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc33Q3ULW6 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc33Q3ULW6 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc33Q3ULW6 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc33Q3ULW6 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc33Q3ULW6 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc33Q3ULW6 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc33Q3ULW6 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc33Q3ULW6 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc33Q3ULW6 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms