Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULD5

Mccc2, Methylcrotonoyl-CoA carboxylase beta chain, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mccc2Q3ULD5 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mccc2Q3ULD5 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Mccc2Q3ULD5 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mccc2Q3ULD5 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mccc2Q3ULD5 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mccc2Q3ULD5 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mccc2Q3ULD5 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mccc2Q3ULD5 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mccc2Q3ULD5 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mccc2Q3ULD5 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mccc2Q3ULD5 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mccc2Q3ULD5 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mccc2Q3ULD5 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mccc2Q3ULD5 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mccc2Q3ULD5 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mccc2Q3ULD5 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mccc2Q3ULD5 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mccc2Q3ULD5 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mccc2Q3ULD5 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mccc2Q3ULD5 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mccc2Q3ULD5 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mccc2Q3ULD5 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mccc2Q3ULD5 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mccc2Q3ULD5 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mccc2Q3ULD5 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mccc2Q3ULD5 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mccc2Q3ULD5 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mccc2Q3ULD5 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mccc2Q3ULD5 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mccc2Q3ULD5 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mccc2Q3ULD5 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mccc2Q3ULD5 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mccc2Q3ULD5 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Mccc2Q3ULD5 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mccc2Q3ULD5 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mccc2Q3ULD5 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mccc2Q3ULD5 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mccc2Q3ULD5 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Mccc2Q3ULD5 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mccc2Q3ULD5 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Mccc2Q3ULD5 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mccc2Q3ULD5 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Mccc2Q3ULD5 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mccc2Q3ULD5 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mccc2Q3ULD5 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mccc2Q3ULD5 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mccc2Q3ULD5 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Mccc2Q3ULD5 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mccc2Q3ULD5 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mccc2Q3ULD5 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mccc2Q3ULD5 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mccc2Q3ULD5 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mccc2Q3ULD5 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mccc2Q3ULD5 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Mccc2Q3ULD5 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mccc2Q3ULD5 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mccc2Q3ULD5 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mccc2Q3ULD5 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mccc2Q3ULD5 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mccc2Q3ULD5 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mccc2Q3ULD5 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mccc2Q3ULD5 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mccc2Q3ULD5 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mccc2Q3ULD5 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mccc2Q3ULD5 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mccc2Q3ULD5 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Mccc2Q3ULD5 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mccc2Q3ULD5 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mccc2Q3ULD5 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mccc2Q3ULD5 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mccc2Q3ULD5 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mccc2Q3ULD5 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mccc2Q3ULD5 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mccc2Q3ULD5 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mccc2Q3ULD5 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Mccc2Q3ULD5 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Mccc2Q3ULD5 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mccc2Q3ULD5 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mccc2Q3ULD5 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mccc2Q3ULD5 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mccc2Q3ULD5 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mccc2Q3ULD5 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mccc2Q3ULD5 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mccc2Q3ULD5 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mccc2Q3ULD5 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mccc2Q3ULD5 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mccc2Q3ULD5 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mccc2Q3ULD5 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mccc2Q3ULD5 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Mccc2Q3ULD5 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mccc2Q3ULD5 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Mccc2Q3ULD5 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mccc2Q3ULD5 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Mccc2Q3ULD5 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mccc2Q3ULD5 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mccc2Q3ULD5 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mccc2Q3ULD5 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mccc2Q3ULD5 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mccc2Q3ULD5 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mccc2Q3ULD5 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms