Protein–RNA interactions for Protein: Q3UKP4

Ceacam12, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 12, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ceacam12Q3UKP4 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ceacam12Q3UKP4 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ceacam12Q3UKP4 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ceacam12Q3UKP4 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ceacam12Q3UKP4 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ceacam12Q3UKP4 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ceacam12Q3UKP4 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ceacam12Q3UKP4 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ceacam12Q3UKP4 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ceacam12Q3UKP4 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ceacam12Q3UKP4 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ceacam12Q3UKP4 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ceacam12Q3UKP4 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ceacam12Q3UKP4 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ceacam12Q3UKP4 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ceacam12Q3UKP4 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ceacam12Q3UKP4 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ceacam12Q3UKP4 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ceacam12Q3UKP4 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ceacam12Q3UKP4 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ceacam12Q3UKP4 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ceacam12Q3UKP4 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ceacam12Q3UKP4 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ceacam12Q3UKP4 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ceacam12Q3UKP4 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ceacam12Q3UKP4 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ceacam12Q3UKP4 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ceacam12Q3UKP4 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ceacam12Q3UKP4 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ceacam12Q3UKP4 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ceacam12Q3UKP4 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Ceacam12Q3UKP4 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Ceacam12Q3UKP4 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ceacam12Q3UKP4 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ceacam12Q3UKP4 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ceacam12Q3UKP4 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ceacam12Q3UKP4 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ceacam12Q3UKP4 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ceacam12Q3UKP4 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ceacam12Q3UKP4 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Ceacam12Q3UKP4 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ceacam12Q3UKP4 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ceacam12Q3UKP4 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ceacam12Q3UKP4 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ceacam12Q3UKP4 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ceacam12Q3UKP4 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ceacam12Q3UKP4 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ceacam12Q3UKP4 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ceacam12Q3UKP4 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ceacam12Q3UKP4 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ceacam12Q3UKP4 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ceacam12Q3UKP4 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ceacam12Q3UKP4 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ceacam12Q3UKP4 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ceacam12Q3UKP4 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ceacam12Q3UKP4 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Ceacam12Q3UKP4 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ceacam12Q3UKP4 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ceacam12Q3UKP4 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ceacam12Q3UKP4 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ceacam12Q3UKP4 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ceacam12Q3UKP4 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ceacam12Q3UKP4 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ceacam12Q3UKP4 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ceacam12Q3UKP4 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ceacam12Q3UKP4 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ceacam12Q3UKP4 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ceacam12Q3UKP4 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ceacam12Q3UKP4 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ceacam12Q3UKP4 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ceacam12Q3UKP4 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ceacam12Q3UKP4 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ceacam12Q3UKP4 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ceacam12Q3UKP4 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ceacam12Q3UKP4 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ceacam12Q3UKP4 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ceacam12Q3UKP4 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ceacam12Q3UKP4 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ceacam12Q3UKP4 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ceacam12Q3UKP4 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ceacam12Q3UKP4 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ceacam12Q3UKP4 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ceacam12Q3UKP4 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ceacam12Q3UKP4 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ceacam12Q3UKP4 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ceacam12Q3UKP4 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ceacam12Q3UKP4 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ceacam12Q3UKP4 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ceacam12Q3UKP4 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ceacam12Q3UKP4 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ceacam12Q3UKP4 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ceacam12Q3UKP4 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ceacam12Q3UKP4 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ceacam12Q3UKP4 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ceacam12Q3UKP4 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ceacam12Q3UKP4 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ceacam12Q3UKP4 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ceacam12Q3UKP4 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ceacam12Q3UKP4 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ceacam12Q3UKP4 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.4 ms