Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc34Q3UI66 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc34Q3UI66 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc34Q3UI66 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc34Q3UI66 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc34Q3UI66 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc34Q3UI66 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc34Q3UI66 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc34Q3UI66 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc34Q3UI66 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc34Q3UI66 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc34Q3UI66 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc34Q3UI66 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc34Q3UI66 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc34Q3UI66 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc34Q3UI66 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc34Q3UI66 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc34Q3UI66 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc34Q3UI66 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc34Q3UI66 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc34Q3UI66 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc34Q3UI66 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc34Q3UI66 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc34Q3UI66 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc34Q3UI66 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc34Q3UI66 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc34Q3UI66 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc34Q3UI66 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc34Q3UI66 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc34Q3UI66 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc34Q3UI66 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc34Q3UI66 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc34Q3UI66 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc34Q3UI66 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc34Q3UI66 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc34Q3UI66 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc34Q3UI66 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc34Q3UI66 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc34Q3UI66 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc34Q3UI66 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc34Q3UI66 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc34Q3UI66 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc34Q3UI66 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc34Q3UI66 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc34Q3UI66 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc34Q3UI66 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc34Q3UI66 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc34Q3UI66 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc34Q3UI66 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc34Q3UI66 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc34Q3UI66 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc34Q3UI66 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc34Q3UI66 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc34Q3UI66 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc34Q3UI66 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc34Q3UI66 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc34Q3UI66 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc34Q3UI66 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc34Q3UI66 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc34Q3UI66 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc34Q3UI66 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc34Q3UI66 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc34Q3UI66 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc34Q3UI66 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc34Q3UI66 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc34Q3UI66 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc34Q3UI66 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc34Q3UI66 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc34Q3UI66 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc34Q3UI66 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc34Q3UI66 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc34Q3UI66 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc34Q3UI66 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc34Q3UI66 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc34Q3UI66 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc34Q3UI66 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc34Q3UI66 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc34Q3UI66 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc34Q3UI66 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc34Q3UI66 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc34Q3UI66 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc34Q3UI66 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc34Q3UI66 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc34Q3UI66 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc34Q3UI66 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc34Q3UI66 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc34Q3UI66 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc34Q3UI66 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc34Q3UI66 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc34Q3UI66 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc34Q3UI66 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc34Q3UI66 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc34Q3UI66 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc34Q3UI66 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc34Q3UI66 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc34Q3UI66 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc34Q3UI66 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc34Q3UI66 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc34Q3UI66 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc34Q3UI66 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms