Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ssbp4Q3U4B1 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Ssbp4Q3U4B1 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ssbp4Q3U4B1 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ssbp4Q3U4B1 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ssbp4Q3U4B1 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ssbp4Q3U4B1 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Ssbp4Q3U4B1 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ssbp4Q3U4B1 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ssbp4Q3U4B1 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ssbp4Q3U4B1 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ssbp4Q3U4B1 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ssbp4Q3U4B1 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ssbp4Q3U4B1 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ssbp4Q3U4B1 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ssbp4Q3U4B1 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ssbp4Q3U4B1 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ssbp4Q3U4B1 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ssbp4Q3U4B1 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Ssbp4Q3U4B1 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ssbp4Q3U4B1 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ssbp4Q3U4B1 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ssbp4Q3U4B1 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ssbp4Q3U4B1 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ssbp4Q3U4B1 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ssbp4Q3U4B1 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ssbp4Q3U4B1 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ssbp4Q3U4B1 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ssbp4Q3U4B1 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ssbp4Q3U4B1 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ssbp4Q3U4B1 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ssbp4Q3U4B1 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ssbp4Q3U4B1 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ssbp4Q3U4B1 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ssbp4Q3U4B1 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ssbp4Q3U4B1 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ssbp4Q3U4B1 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ssbp4Q3U4B1 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ssbp4Q3U4B1 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ssbp4Q3U4B1 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ssbp4Q3U4B1 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ssbp4Q3U4B1 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ssbp4Q3U4B1 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Ssbp4Q3U4B1 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Ssbp4Q3U4B1 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ssbp4Q3U4B1 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Ssbp4Q3U4B1 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ssbp4Q3U4B1 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ssbp4Q3U4B1 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ssbp4Q3U4B1 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ssbp4Q3U4B1 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ssbp4Q3U4B1 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ssbp4Q3U4B1 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ssbp4Q3U4B1 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ssbp4Q3U4B1 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ssbp4Q3U4B1 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ssbp4Q3U4B1 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ssbp4Q3U4B1 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ssbp4Q3U4B1 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ssbp4Q3U4B1 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ssbp4Q3U4B1 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ssbp4Q3U4B1 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ssbp4Q3U4B1 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ssbp4Q3U4B1 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ssbp4Q3U4B1 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ssbp4Q3U4B1 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC12.33□□□□□ -0.43
Ssbp4Q3U4B1 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Ssbp4Q3U4B1 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Ssbp4Q3U4B1 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Ssbp4Q3U4B1 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Ssbp4Q3U4B1 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ssbp4Q3U4B1 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
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