Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K5

Kdm4d, Lysine-specific demethylase 4D, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4dQ3U2K5 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Kdm4dQ3U2K5 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Kdm4dQ3U2K5 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Kdm4dQ3U2K5 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Kdm4dQ3U2K5 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Kdm4dQ3U2K5 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Kdm4dQ3U2K5 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Kdm4dQ3U2K5 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Kdm4dQ3U2K5 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Kdm4dQ3U2K5 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Kdm4dQ3U2K5 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Kdm4dQ3U2K5 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Kdm4dQ3U2K5 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Kdm4dQ3U2K5 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Kdm4dQ3U2K5 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Kdm4dQ3U2K5 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Kdm4dQ3U2K5 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Kdm4dQ3U2K5 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Kdm4dQ3U2K5 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Kdm4dQ3U2K5 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Kdm4dQ3U2K5 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Kdm4dQ3U2K5 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Kdm4dQ3U2K5 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Kdm4dQ3U2K5 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Kdm4dQ3U2K5 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Kdm4dQ3U2K5 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Kdm4dQ3U2K5 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Kdm4dQ3U2K5 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Kdm4dQ3U2K5 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Kdm4dQ3U2K5 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Kdm4dQ3U2K5 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Kdm4dQ3U2K5 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Kdm4dQ3U2K5 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC14□□□□□ -0.17
Kdm4dQ3U2K5 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Kdm4dQ3U2K5 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Kdm4dQ3U2K5 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Kdm4dQ3U2K5 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Kdm4dQ3U2K5 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Kdm4dQ3U2K5 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Kdm4dQ3U2K5 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Kdm4dQ3U2K5 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Kdm4dQ3U2K5 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Kdm4dQ3U2K5 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Kdm4dQ3U2K5 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Kdm4dQ3U2K5 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Kdm4dQ3U2K5 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Kdm4dQ3U2K5 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Kdm4dQ3U2K5 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Kdm4dQ3U2K5 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Kdm4dQ3U2K5 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Kdm4dQ3U2K5 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Kdm4dQ3U2K5 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Kdm4dQ3U2K5 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Kdm4dQ3U2K5 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Kdm4dQ3U2K5 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Kdm4dQ3U2K5 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Kdm4dQ3U2K5 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Kdm4dQ3U2K5 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Kdm4dQ3U2K5 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Kdm4dQ3U2K5 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Kdm4dQ3U2K5 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Kdm4dQ3U2K5 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Kdm4dQ3U2K5 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Kdm4dQ3U2K5 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Kdm4dQ3U2K5 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Kdm4dQ3U2K5 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Kdm4dQ3U2K5 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Kdm4dQ3U2K5 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Kdm4dQ3U2K5 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Kdm4dQ3U2K5 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Kdm4dQ3U2K5 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Kdm4dQ3U2K5 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Kdm4dQ3U2K5 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Kdm4dQ3U2K5 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Kdm4dQ3U2K5 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Kdm4dQ3U2K5 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Kdm4dQ3U2K5 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Kdm4dQ3U2K5 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Kdm4dQ3U2K5 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Kdm4dQ3U2K5 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Kdm4dQ3U2K5 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Kdm4dQ3U2K5 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Kdm4dQ3U2K5 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Kdm4dQ3U2K5 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Kdm4dQ3U2K5 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Kdm4dQ3U2K5 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Kdm4dQ3U2K5 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Kdm4dQ3U2K5 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Kdm4dQ3U2K5 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Kdm4dQ3U2K5 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Kdm4dQ3U2K5 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Kdm4dQ3U2K5 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Kdm4dQ3U2K5 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Kdm4dQ3U2K5 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Kdm4dQ3U2K5 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Kdm4dQ3U2K5 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Kdm4dQ3U2K5 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Kdm4dQ3U2K5 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Kdm4dQ3U2K5 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Kdm4dQ3U2K5 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms