Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccndbp1Q3TVC7 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccndbp1Q3TVC7 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccndbp1Q3TVC7 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccndbp1Q3TVC7 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccndbp1Q3TVC7 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccndbp1Q3TVC7 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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