Protein–RNA interactions for Protein: Q3TT99

Gdpd4, Glycerophosphodiester phosphodiesterase domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 632 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd4Q3TT99 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gdpd4Q3TT99 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gdpd4Q3TT99 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gdpd4Q3TT99 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gdpd4Q3TT99 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gdpd4Q3TT99 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gdpd4Q3TT99 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gdpd4Q3TT99 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gdpd4Q3TT99 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gdpd4Q3TT99 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gdpd4Q3TT99 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gdpd4Q3TT99 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gdpd4Q3TT99 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gdpd4Q3TT99 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gdpd4Q3TT99 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gdpd4Q3TT99 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gdpd4Q3TT99 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gdpd4Q3TT99 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gdpd4Q3TT99 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gdpd4Q3TT99 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gdpd4Q3TT99 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gdpd4Q3TT99 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gdpd4Q3TT99 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gdpd4Q3TT99 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gdpd4Q3TT99 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gdpd4Q3TT99 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gdpd4Q3TT99 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gdpd4Q3TT99 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gdpd4Q3TT99 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gdpd4Q3TT99 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gdpd4Q3TT99 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gdpd4Q3TT99 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gdpd4Q3TT99 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gdpd4Q3TT99 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gdpd4Q3TT99 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gdpd4Q3TT99 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gdpd4Q3TT99 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gdpd4Q3TT99 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gdpd4Q3TT99 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gdpd4Q3TT99 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gdpd4Q3TT99 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gdpd4Q3TT99 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gdpd4Q3TT99 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gdpd4Q3TT99 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gdpd4Q3TT99 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gdpd4Q3TT99 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gdpd4Q3TT99 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gdpd4Q3TT99 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gdpd4Q3TT99 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gdpd4Q3TT99 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gdpd4Q3TT99 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gdpd4Q3TT99 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gdpd4Q3TT99 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gdpd4Q3TT99 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gdpd4Q3TT99 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gdpd4Q3TT99 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gdpd4Q3TT99 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gdpd4Q3TT99 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gdpd4Q3TT99 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gdpd4Q3TT99 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gdpd4Q3TT99 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gdpd4Q3TT99 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gdpd4Q3TT99 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gdpd4Q3TT99 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gdpd4Q3TT99 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gdpd4Q3TT99 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gdpd4Q3TT99 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gdpd4Q3TT99 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gdpd4Q3TT99 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gdpd4Q3TT99 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gdpd4Q3TT99 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gdpd4Q3TT99 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gdpd4Q3TT99 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gdpd4Q3TT99 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gdpd4Q3TT99 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Gdpd4Q3TT99 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gdpd4Q3TT99 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gdpd4Q3TT99 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gdpd4Q3TT99 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gdpd4Q3TT99 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gdpd4Q3TT99 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gdpd4Q3TT99 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gdpd4Q3TT99 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gdpd4Q3TT99 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gdpd4Q3TT99 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gdpd4Q3TT99 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gdpd4Q3TT99 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gdpd4Q3TT99 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gdpd4Q3TT99 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gdpd4Q3TT99 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gdpd4Q3TT99 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gdpd4Q3TT99 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gdpd4Q3TT99 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gdpd4Q3TT99 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gdpd4Q3TT99 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gdpd4Q3TT99 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gdpd4Q3TT99 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gdpd4Q3TT99 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gdpd4Q3TT99 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gdpd4Q3TT99 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms