Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctdnep1Q3TP92 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctdnep1Q3TP92 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctdnep1Q3TP92 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ctdnep1Q3TP92 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ctdnep1Q3TP92 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ctdnep1Q3TP92 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ctdnep1Q3TP92 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ctdnep1Q3TP92 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ctdnep1Q3TP92 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ctdnep1Q3TP92 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ctdnep1Q3TP92 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ctdnep1Q3TP92 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ctdnep1Q3TP92 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ctdnep1Q3TP92 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ctdnep1Q3TP92 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ctdnep1Q3TP92 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ctdnep1Q3TP92 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ctdnep1Q3TP92 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ctdnep1Q3TP92 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ctdnep1Q3TP92 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ctdnep1Q3TP92 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ctdnep1Q3TP92 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ctdnep1Q3TP92 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ctdnep1Q3TP92 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ctdnep1Q3TP92 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ctdnep1Q3TP92 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ctdnep1Q3TP92 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ctdnep1Q3TP92 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ctdnep1Q3TP92 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ctdnep1Q3TP92 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ctdnep1Q3TP92 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ctdnep1Q3TP92 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ctdnep1Q3TP92 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ctdnep1Q3TP92 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ctdnep1Q3TP92 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ctdnep1Q3TP92 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ctdnep1Q3TP92 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ctdnep1Q3TP92 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ctdnep1Q3TP92 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ctdnep1Q3TP92 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ctdnep1Q3TP92 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ctdnep1Q3TP92 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ctdnep1Q3TP92 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ctdnep1Q3TP92 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ctdnep1Q3TP92 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ctdnep1Q3TP92 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ctdnep1Q3TP92 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ctdnep1Q3TP92 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ctdnep1Q3TP92 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ctdnep1Q3TP92 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ctdnep1Q3TP92 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ctdnep1Q3TP92 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ctdnep1Q3TP92 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ctdnep1Q3TP92 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ctdnep1Q3TP92 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ctdnep1Q3TP92 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ctdnep1Q3TP92 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ctdnep1Q3TP92 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ctdnep1Q3TP92 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ctdnep1Q3TP92 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ctdnep1Q3TP92 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ctdnep1Q3TP92 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ctdnep1Q3TP92 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ctdnep1Q3TP92 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ctdnep1Q3TP92 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ctdnep1Q3TP92 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ctdnep1Q3TP92 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ctdnep1Q3TP92 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ctdnep1Q3TP92 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ctdnep1Q3TP92 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ctdnep1Q3TP92 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ctdnep1Q3TP92 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ctdnep1Q3TP92 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ctdnep1Q3TP92 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ctdnep1Q3TP92 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ctdnep1Q3TP92 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ctdnep1Q3TP92 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ctdnep1Q3TP92 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ctdnep1Q3TP92 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ctdnep1Q3TP92 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ctdnep1Q3TP92 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ctdnep1Q3TP92 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ctdnep1Q3TP92 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ctdnep1Q3TP92 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ctdnep1Q3TP92 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ctdnep1Q3TP92 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ctdnep1Q3TP92 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ctdnep1Q3TP92 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ctdnep1Q3TP92 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ctdnep1Q3TP92 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ctdnep1Q3TP92 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ctdnep1Q3TP92 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ctdnep1Q3TP92 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ctdnep1Q3TP92 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ctdnep1Q3TP92 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ctdnep1Q3TP92 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ctdnep1Q3TP92 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ctdnep1Q3TP92 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ctdnep1Q3TP92 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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