Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

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Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp39Q3TIX9 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp39Q3TIX9 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp39Q3TIX9 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp39Q3TIX9 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp39Q3TIX9 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp39Q3TIX9 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp39Q3TIX9 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp39Q3TIX9 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp39Q3TIX9 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp39Q3TIX9 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp39Q3TIX9 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp39Q3TIX9 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp39Q3TIX9 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp39Q3TIX9 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp39Q3TIX9 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp39Q3TIX9 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp39Q3TIX9 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp39Q3TIX9 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp39Q3TIX9 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp39Q3TIX9 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp39Q3TIX9 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp39Q3TIX9 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp39Q3TIX9 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp39Q3TIX9 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp39Q3TIX9 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp39Q3TIX9 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp39Q3TIX9 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp39Q3TIX9 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp39Q3TIX9 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp39Q3TIX9 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp39Q3TIX9 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp39Q3TIX9 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp39Q3TIX9 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp39Q3TIX9 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp39Q3TIX9 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp39Q3TIX9 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp39Q3TIX9 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp39Q3TIX9 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp39Q3TIX9 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
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Usp39Q3TIX9 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp39Q3TIX9 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp39Q3TIX9 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp39Q3TIX9 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp39Q3TIX9 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp39Q3TIX9 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp39Q3TIX9 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp39Q3TIX9 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp39Q3TIX9 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp39Q3TIX9 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp39Q3TIX9 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp39Q3TIX9 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp39Q3TIX9 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp39Q3TIX9 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp39Q3TIX9 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp39Q3TIX9 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp39Q3TIX9 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp39Q3TIX9 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
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Usp39Q3TIX9 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp39Q3TIX9 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
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Usp39Q3TIX9 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp39Q3TIX9 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
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Usp39Q3TIX9 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp39Q3TIX9 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp39Q3TIX9 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp39Q3TIX9 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp39Q3TIX9 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp39Q3TIX9 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp39Q3TIX9 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp39Q3TIX9 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp39Q3TIX9 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp39Q3TIX9 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp39Q3TIX9 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp39Q3TIX9 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp39Q3TIX9 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp39Q3TIX9 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp39Q3TIX9 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp39Q3TIX9 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp39Q3TIX9 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp39Q3TIX9 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp39Q3TIX9 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp39Q3TIX9 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp39Q3TIX9 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp39Q3TIX9 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp39Q3TIX9 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp39Q3TIX9 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp39Q3TIX9 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp39Q3TIX9 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
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