Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXD3

Hddc2, HD domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 199 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc2Q3SXD3 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hddc2Q3SXD3 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hddc2Q3SXD3 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hddc2Q3SXD3 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hddc2Q3SXD3 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hddc2Q3SXD3 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hddc2Q3SXD3 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hddc2Q3SXD3 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hddc2Q3SXD3 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hddc2Q3SXD3 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hddc2Q3SXD3 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hddc2Q3SXD3 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hddc2Q3SXD3 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hddc2Q3SXD3 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hddc2Q3SXD3 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hddc2Q3SXD3 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hddc2Q3SXD3 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hddc2Q3SXD3 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hddc2Q3SXD3 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hddc2Q3SXD3 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hddc2Q3SXD3 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hddc2Q3SXD3 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hddc2Q3SXD3 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hddc2Q3SXD3 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Hddc2Q3SXD3 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Hddc2Q3SXD3 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hddc2Q3SXD3 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hddc2Q3SXD3 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hddc2Q3SXD3 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hddc2Q3SXD3 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hddc2Q3SXD3 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hddc2Q3SXD3 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hddc2Q3SXD3 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hddc2Q3SXD3 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hddc2Q3SXD3 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hddc2Q3SXD3 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hddc2Q3SXD3 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hddc2Q3SXD3 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Hddc2Q3SXD3 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hddc2Q3SXD3 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hddc2Q3SXD3 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hddc2Q3SXD3 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hddc2Q3SXD3 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Hddc2Q3SXD3 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hddc2Q3SXD3 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hddc2Q3SXD3 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hddc2Q3SXD3 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hddc2Q3SXD3 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hddc2Q3SXD3 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hddc2Q3SXD3 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hddc2Q3SXD3 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hddc2Q3SXD3 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hddc2Q3SXD3 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hddc2Q3SXD3 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hddc2Q3SXD3 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hddc2Q3SXD3 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hddc2Q3SXD3 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hddc2Q3SXD3 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hddc2Q3SXD3 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hddc2Q3SXD3 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hddc2Q3SXD3 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hddc2Q3SXD3 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hddc2Q3SXD3 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hddc2Q3SXD3 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hddc2Q3SXD3 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hddc2Q3SXD3 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hddc2Q3SXD3 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hddc2Q3SXD3 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hddc2Q3SXD3 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hddc2Q3SXD3 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hddc2Q3SXD3 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hddc2Q3SXD3 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hddc2Q3SXD3 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hddc2Q3SXD3 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hddc2Q3SXD3 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hddc2Q3SXD3 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hddc2Q3SXD3 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hddc2Q3SXD3 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hddc2Q3SXD3 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hddc2Q3SXD3 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hddc2Q3SXD3 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hddc2Q3SXD3 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Hddc2Q3SXD3 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hddc2Q3SXD3 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hddc2Q3SXD3 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hddc2Q3SXD3 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hddc2Q3SXD3 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hddc2Q3SXD3 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hddc2Q3SXD3 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hddc2Q3SXD3 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Hddc2Q3SXD3 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hddc2Q3SXD3 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hddc2Q3SXD3 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hddc2Q3SXD3 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hddc2Q3SXD3 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hddc2Q3SXD3 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hddc2Q3SXD3 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hddc2Q3SXD3 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hddc2Q3SXD3 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hddc2Q3SXD3 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
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