Protein–RNA interactions for Protein: Q2MKA5

Chrna5, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna5Q2MKA5 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Chrna5Q2MKA5 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Chrna5Q2MKA5 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Chrna5Q2MKA5 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Chrna5Q2MKA5 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Chrna5Q2MKA5 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Chrna5Q2MKA5 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Chrna5Q2MKA5 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Chrna5Q2MKA5 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Chrna5Q2MKA5 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Chrna5Q2MKA5 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Chrna5Q2MKA5 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Chrna5Q2MKA5 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Chrna5Q2MKA5 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Chrna5Q2MKA5 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Chrna5Q2MKA5 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Chrna5Q2MKA5 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Chrna5Q2MKA5 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Chrna5Q2MKA5 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Chrna5Q2MKA5 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Chrna5Q2MKA5 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Chrna5Q2MKA5 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Chrna5Q2MKA5 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Chrna5Q2MKA5 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Chrna5Q2MKA5 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Chrna5Q2MKA5 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Chrna5Q2MKA5 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Chrna5Q2MKA5 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Chrna5Q2MKA5 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Chrna5Q2MKA5 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Chrna5Q2MKA5 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Chrna5Q2MKA5 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Chrna5Q2MKA5 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Chrna5Q2MKA5 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Chrna5Q2MKA5 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Chrna5Q2MKA5 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Chrna5Q2MKA5 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Chrna5Q2MKA5 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Chrna5Q2MKA5 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Chrna5Q2MKA5 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Chrna5Q2MKA5 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Chrna5Q2MKA5 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Chrna5Q2MKA5 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Chrna5Q2MKA5 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Chrna5Q2MKA5 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Chrna5Q2MKA5 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Chrna5Q2MKA5 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Chrna5Q2MKA5 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Chrna5Q2MKA5 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Chrna5Q2MKA5 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Chrna5Q2MKA5 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Chrna5Q2MKA5 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Chrna5Q2MKA5 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Chrna5Q2MKA5 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Chrna5Q2MKA5 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Chrna5Q2MKA5 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Chrna5Q2MKA5 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Chrna5Q2MKA5 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Chrna5Q2MKA5 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Chrna5Q2MKA5 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Chrna5Q2MKA5 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Chrna5Q2MKA5 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Chrna5Q2MKA5 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Chrna5Q2MKA5 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Chrna5Q2MKA5 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Chrna5Q2MKA5 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Chrna5Q2MKA5 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Chrna5Q2MKA5 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Chrna5Q2MKA5 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Chrna5Q2MKA5 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Chrna5Q2MKA5 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Chrna5Q2MKA5 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Chrna5Q2MKA5 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Chrna5Q2MKA5 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Chrna5Q2MKA5 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Chrna5Q2MKA5 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Chrna5Q2MKA5 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Chrna5Q2MKA5 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Chrna5Q2MKA5 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Chrna5Q2MKA5 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Chrna5Q2MKA5 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Chrna5Q2MKA5 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Chrna5Q2MKA5 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Chrna5Q2MKA5 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Chrna5Q2MKA5 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Chrna5Q2MKA5 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Chrna5Q2MKA5 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Chrna5Q2MKA5 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Chrna5Q2MKA5 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Chrna5Q2MKA5 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Chrna5Q2MKA5 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Chrna5Q2MKA5 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Chrna5Q2MKA5 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Chrna5Q2MKA5 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Chrna5Q2MKA5 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Chrna5Q2MKA5 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Chrna5Q2MKA5 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Chrna5Q2MKA5 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Chrna5Q2MKA5 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Chrna5Q2MKA5 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms