Protein–RNA interactions for Protein: Q1W617

Shroom4, Protein Shroom4, mousemouse

Predictions only

Length 1,475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shroom4Q1W617 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
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Shroom4Q1W617 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
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Shroom4Q1W617 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
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Shroom4Q1W617 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
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Shroom4Q1W617 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Shroom4Q1W617 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
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Shroom4Q1W617 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Shroom4Q1W617 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Shroom4Q1W617 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Shroom4Q1W617 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Shroom4Q1W617 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Shroom4Q1W617 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
Shroom4Q1W617 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Shroom4Q1W617 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Shroom4Q1W617 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Shroom4Q1W617 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Shroom4Q1W617 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Shroom4Q1W617 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Shroom4Q1W617 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Shroom4Q1W617 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Shroom4Q1W617 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Shroom4Q1W617 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Shroom4Q1W617 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Shroom4Q1W617 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Shroom4Q1W617 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Shroom4Q1W617 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
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