Protein–RNA interactions for Protein: Q1RNF8

Samd11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd11Q1RNF8 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Samd11Q1RNF8 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Samd11Q1RNF8 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Samd11Q1RNF8 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Samd11Q1RNF8 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Samd11Q1RNF8 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Samd11Q1RNF8 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Samd11Q1RNF8 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Samd11Q1RNF8 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Samd11Q1RNF8 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Samd11Q1RNF8 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Samd11Q1RNF8 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Samd11Q1RNF8 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Samd11Q1RNF8 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Samd11Q1RNF8 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Samd11Q1RNF8 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Samd11Q1RNF8 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Samd11Q1RNF8 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Samd11Q1RNF8 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Samd11Q1RNF8 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Samd11Q1RNF8 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Samd11Q1RNF8 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Samd11Q1RNF8 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Samd11Q1RNF8 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Samd11Q1RNF8 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Samd11Q1RNF8 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Samd11Q1RNF8 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Samd11Q1RNF8 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Samd11Q1RNF8 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Samd11Q1RNF8 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Samd11Q1RNF8 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Samd11Q1RNF8 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Samd11Q1RNF8 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Samd11Q1RNF8 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Samd11Q1RNF8 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Samd11Q1RNF8 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Samd11Q1RNF8 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Samd11Q1RNF8 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Samd11Q1RNF8 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Samd11Q1RNF8 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Samd11Q1RNF8 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Samd11Q1RNF8 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Samd11Q1RNF8 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Samd11Q1RNF8 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Samd11Q1RNF8 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Samd11Q1RNF8 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Samd11Q1RNF8 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Samd11Q1RNF8 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Samd11Q1RNF8 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Samd11Q1RNF8 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Samd11Q1RNF8 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Samd11Q1RNF8 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Samd11Q1RNF8 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Samd11Q1RNF8 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Samd11Q1RNF8 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Samd11Q1RNF8 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Samd11Q1RNF8 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Samd11Q1RNF8 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Samd11Q1RNF8 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Samd11Q1RNF8 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Samd11Q1RNF8 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Samd11Q1RNF8 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Samd11Q1RNF8 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Samd11Q1RNF8 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Samd11Q1RNF8 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Samd11Q1RNF8 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Samd11Q1RNF8 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Samd11Q1RNF8 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Samd11Q1RNF8 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Samd11Q1RNF8 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Samd11Q1RNF8 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Samd11Q1RNF8 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Samd11Q1RNF8 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Samd11Q1RNF8 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Samd11Q1RNF8 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Samd11Q1RNF8 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Samd11Q1RNF8 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Samd11Q1RNF8 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Samd11Q1RNF8 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Samd11Q1RNF8 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Samd11Q1RNF8 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Samd11Q1RNF8 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Samd11Q1RNF8 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Samd11Q1RNF8 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Samd11Q1RNF8 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Samd11Q1RNF8 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Samd11Q1RNF8 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Samd11Q1RNF8 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Samd11Q1RNF8 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Samd11Q1RNF8 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Samd11Q1RNF8 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Samd11Q1RNF8 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Samd11Q1RNF8 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Samd11Q1RNF8 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Samd11Q1RNF8 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Samd11Q1RNF8 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Samd11Q1RNF8 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Samd11Q1RNF8 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Samd11Q1RNF8 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Samd11Q1RNF8 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.4 ms