Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim71Q1PSW8 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim71Q1PSW8 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim71Q1PSW8 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim71Q1PSW8 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim71Q1PSW8 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim71Q1PSW8 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim71Q1PSW8 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim71Q1PSW8 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim71Q1PSW8 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim71Q1PSW8 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim71Q1PSW8 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim71Q1PSW8 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim71Q1PSW8 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim71Q1PSW8 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim71Q1PSW8 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim71Q1PSW8 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim71Q1PSW8 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim71Q1PSW8 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim71Q1PSW8 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim71Q1PSW8 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim71Q1PSW8 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim71Q1PSW8 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim71Q1PSW8 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim71Q1PSW8 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim71Q1PSW8 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim71Q1PSW8 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim71Q1PSW8 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim71Q1PSW8 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim71Q1PSW8 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim71Q1PSW8 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim71Q1PSW8 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim71Q1PSW8 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim71Q1PSW8 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim71Q1PSW8 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim71Q1PSW8 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim71Q1PSW8 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim71Q1PSW8 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim71Q1PSW8 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim71Q1PSW8 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim71Q1PSW8 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim71Q1PSW8 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim71Q1PSW8 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim71Q1PSW8 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim71Q1PSW8 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim71Q1PSW8 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim71Q1PSW8 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim71Q1PSW8 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim71Q1PSW8 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim71Q1PSW8 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim71Q1PSW8 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim71Q1PSW8 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim71Q1PSW8 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim71Q1PSW8 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim71Q1PSW8 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim71Q1PSW8 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim71Q1PSW8 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim71Q1PSW8 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim71Q1PSW8 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim71Q1PSW8 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim71Q1PSW8 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim71Q1PSW8 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim71Q1PSW8 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim71Q1PSW8 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim71Q1PSW8 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim71Q1PSW8 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim71Q1PSW8 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim71Q1PSW8 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim71Q1PSW8 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim71Q1PSW8 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim71Q1PSW8 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim71Q1PSW8 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim71Q1PSW8 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim71Q1PSW8 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim71Q1PSW8 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim71Q1PSW8 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim71Q1PSW8 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim71Q1PSW8 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim71Q1PSW8 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim71Q1PSW8 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim71Q1PSW8 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim71Q1PSW8 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim71Q1PSW8 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim71Q1PSW8 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim71Q1PSW8 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim71Q1PSW8 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim71Q1PSW8 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim71Q1PSW8 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim71Q1PSW8 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim71Q1PSW8 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim71Q1PSW8 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim71Q1PSW8 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim71Q1PSW8 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim71Q1PSW8 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim71Q1PSW8 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim71Q1PSW8 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim71Q1PSW8 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim71Q1PSW8 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim71Q1PSW8 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim71Q1PSW8 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms