Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

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Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rpusd3Q14AI6 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rpusd3Q14AI6 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rpusd3Q14AI6 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rpusd3Q14AI6 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rpusd3Q14AI6 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
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Rpusd3Q14AI6 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rpusd3Q14AI6 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rpusd3Q14AI6 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rpusd3Q14AI6 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rpusd3Q14AI6 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rpusd3Q14AI6 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rpusd3Q14AI6 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rpusd3Q14AI6 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rpusd3Q14AI6 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rpusd3Q14AI6 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rpusd3Q14AI6 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rpusd3Q14AI6 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rpusd3Q14AI6 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpusd3Q14AI6 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpusd3Q14AI6 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpusd3Q14AI6 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpusd3Q14AI6 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpusd3Q14AI6 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpusd3Q14AI6 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Rpusd3Q14AI6 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpusd3Q14AI6 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Rpusd3Q14AI6 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpusd3Q14AI6 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpusd3Q14AI6 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpusd3Q14AI6 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Rpusd3Q14AI6 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpusd3Q14AI6 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Rpusd3Q14AI6 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpusd3Q14AI6 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpusd3Q14AI6 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Rpusd3Q14AI6 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Rpusd3Q14AI6 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Rpusd3Q14AI6 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Rpusd3Q14AI6 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Rpusd3Q14AI6 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpusd3Q14AI6 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpusd3Q14AI6 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpusd3Q14AI6 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpusd3Q14AI6 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpusd3Q14AI6 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpusd3Q14AI6 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Rpusd3Q14AI6 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpusd3Q14AI6 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Rpusd3Q14AI6 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpusd3Q14AI6 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpusd3Q14AI6 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpusd3Q14AI6 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpusd3Q14AI6 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpusd3Q14AI6 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpusd3Q14AI6 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpusd3Q14AI6 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpusd3Q14AI6 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpusd3Q14AI6 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpusd3Q14AI6 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpusd3Q14AI6 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpusd3Q14AI6 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpusd3Q14AI6 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpusd3Q14AI6 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpusd3Q14AI6 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpusd3Q14AI6 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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