Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF58

Col19a1, Collagen alpha-1(XIX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col19a1Q0VF58 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Col19a1Q0VF58 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Col19a1Q0VF58 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Col19a1Q0VF58 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col19a1Q0VF58 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col19a1Q0VF58 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col19a1Q0VF58 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col19a1Q0VF58 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col19a1Q0VF58 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col19a1Q0VF58 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col19a1Q0VF58 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col19a1Q0VF58 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Col19a1Q0VF58 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col19a1Q0VF58 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col19a1Q0VF58 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col19a1Q0VF58 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col19a1Q0VF58 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col19a1Q0VF58 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col19a1Q0VF58 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col19a1Q0VF58 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Col19a1Q0VF58 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col19a1Q0VF58 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col19a1Q0VF58 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col19a1Q0VF58 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col19a1Q0VF58 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col19a1Q0VF58 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Col19a1Q0VF58 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Col19a1Q0VF58 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col19a1Q0VF58 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Col19a1Q0VF58 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col19a1Q0VF58 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col19a1Q0VF58 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col19a1Q0VF58 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col19a1Q0VF58 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col19a1Q0VF58 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col19a1Q0VF58 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col19a1Q0VF58 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Col19a1Q0VF58 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Col19a1Q0VF58 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col19a1Q0VF58 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Col19a1Q0VF58 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Col19a1Q0VF58 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Col19a1Q0VF58 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Col19a1Q0VF58 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Col19a1Q0VF58 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Col19a1Q0VF58 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Col19a1Q0VF58 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Col19a1Q0VF58 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Col19a1Q0VF58 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col19a1Q0VF58 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col19a1Q0VF58 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col19a1Q0VF58 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col19a1Q0VF58 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col19a1Q0VF58 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col19a1Q0VF58 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col19a1Q0VF58 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col19a1Q0VF58 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col19a1Q0VF58 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col19a1Q0VF58 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col19a1Q0VF58 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col19a1Q0VF58 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col19a1Q0VF58 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col19a1Q0VF58 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col19a1Q0VF58 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col19a1Q0VF58 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col19a1Q0VF58 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col19a1Q0VF58 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col19a1Q0VF58 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col19a1Q0VF58 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col19a1Q0VF58 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col19a1Q0VF58 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col19a1Q0VF58 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col19a1Q0VF58 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col19a1Q0VF58 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col19a1Q0VF58 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col19a1Q0VF58 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col19a1Q0VF58 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col19a1Q0VF58 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col19a1Q0VF58 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col19a1Q0VF58 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Col19a1Q0VF58 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Col19a1Q0VF58 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col19a1Q0VF58 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col19a1Q0VF58 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col19a1Q0VF58 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col19a1Q0VF58 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col19a1Q0VF58 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col19a1Q0VF58 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col19a1Q0VF58 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Col19a1Q0VF58 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col19a1Q0VF58 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col19a1Q0VF58 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col19a1Q0VF58 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col19a1Q0VF58 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col19a1Q0VF58 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col19a1Q0VF58 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col19a1Q0VF58 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col19a1Q0VF58 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col19a1Q0VF58 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col19a1Q0VF58 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms