Protein–RNA interactions for Protein: Q0VE82

Cpne7, Copine-7, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne7Q0VE82 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cpne7Q0VE82 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cpne7Q0VE82 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cpne7Q0VE82 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cpne7Q0VE82 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cpne7Q0VE82 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cpne7Q0VE82 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cpne7Q0VE82 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cpne7Q0VE82 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cpne7Q0VE82 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cpne7Q0VE82 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cpne7Q0VE82 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cpne7Q0VE82 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cpne7Q0VE82 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cpne7Q0VE82 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cpne7Q0VE82 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cpne7Q0VE82 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cpne7Q0VE82 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cpne7Q0VE82 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cpne7Q0VE82 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cpne7Q0VE82 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cpne7Q0VE82 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cpne7Q0VE82 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cpne7Q0VE82 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cpne7Q0VE82 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cpne7Q0VE82 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cpne7Q0VE82 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cpne7Q0VE82 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cpne7Q0VE82 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cpne7Q0VE82 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cpne7Q0VE82 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cpne7Q0VE82 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cpne7Q0VE82 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cpne7Q0VE82 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cpne7Q0VE82 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cpne7Q0VE82 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cpne7Q0VE82 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cpne7Q0VE82 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cpne7Q0VE82 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cpne7Q0VE82 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cpne7Q0VE82 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Cpne7Q0VE82 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cpne7Q0VE82 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cpne7Q0VE82 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Cpne7Q0VE82 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cpne7Q0VE82 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cpne7Q0VE82 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cpne7Q0VE82 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cpne7Q0VE82 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cpne7Q0VE82 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cpne7Q0VE82 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cpne7Q0VE82 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cpne7Q0VE82 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cpne7Q0VE82 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cpne7Q0VE82 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cpne7Q0VE82 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cpne7Q0VE82 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cpne7Q0VE82 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cpne7Q0VE82 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cpne7Q0VE82 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cpne7Q0VE82 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cpne7Q0VE82 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cpne7Q0VE82 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cpne7Q0VE82 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cpne7Q0VE82 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cpne7Q0VE82 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cpne7Q0VE82 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cpne7Q0VE82 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cpne7Q0VE82 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cpne7Q0VE82 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cpne7Q0VE82 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cpne7Q0VE82 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cpne7Q0VE82 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cpne7Q0VE82 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cpne7Q0VE82 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cpne7Q0VE82 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cpne7Q0VE82 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cpne7Q0VE82 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cpne7Q0VE82 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cpne7Q0VE82 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cpne7Q0VE82 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cpne7Q0VE82 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cpne7Q0VE82 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cpne7Q0VE82 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cpne7Q0VE82 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cpne7Q0VE82 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cpne7Q0VE82 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cpne7Q0VE82 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cpne7Q0VE82 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cpne7Q0VE82 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cpne7Q0VE82 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cpne7Q0VE82 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cpne7Q0VE82 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cpne7Q0VE82 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cpne7Q0VE82 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cpne7Q0VE82 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cpne7Q0VE82 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cpne7Q0VE82 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cpne7Q0VE82 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cpne7Q0VE82 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms