Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rundc1Q0VDN7 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rundc1Q0VDN7 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rundc1Q0VDN7 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rundc1Q0VDN7 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rundc1Q0VDN7 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Rundc1Q0VDN7 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Rundc1Q0VDN7 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Rundc1Q0VDN7 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Rundc1Q0VDN7 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Rundc1Q0VDN7 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Rundc1Q0VDN7 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Rundc1Q0VDN7 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Rundc1Q0VDN7 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Rundc1Q0VDN7 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Rundc1Q0VDN7 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Rundc1Q0VDN7 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Rundc1Q0VDN7 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Rundc1Q0VDN7 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Rundc1Q0VDN7 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Rundc1Q0VDN7 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Rundc1Q0VDN7 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Rundc1Q0VDN7 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Rundc1Q0VDN7 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Rundc1Q0VDN7 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Rundc1Q0VDN7 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Rundc1Q0VDN7 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Rundc1Q0VDN7 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Rundc1Q0VDN7 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rundc1Q0VDN7 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rundc1Q0VDN7 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rundc1Q0VDN7 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rundc1Q0VDN7 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rundc1Q0VDN7 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rundc1Q0VDN7 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rundc1Q0VDN7 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rundc1Q0VDN7 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rundc1Q0VDN7 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rundc1Q0VDN7 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rundc1Q0VDN7 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rundc1Q0VDN7 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rundc1Q0VDN7 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rundc1Q0VDN7 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rundc1Q0VDN7 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rundc1Q0VDN7 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rundc1Q0VDN7 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rundc1Q0VDN7 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rundc1Q0VDN7 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rundc1Q0VDN7 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rundc1Q0VDN7 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rundc1Q0VDN7 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rundc1Q0VDN7 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rundc1Q0VDN7 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rundc1Q0VDN7 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rundc1Q0VDN7 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rundc1Q0VDN7 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rundc1Q0VDN7 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rundc1Q0VDN7 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rundc1Q0VDN7 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rundc1Q0VDN7 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rundc1Q0VDN7 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Rundc1Q0VDN7 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rundc1Q0VDN7 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rundc1Q0VDN7 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rundc1Q0VDN7 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Rundc1Q0VDN7 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rundc1Q0VDN7 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Rundc1Q0VDN7 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rundc1Q0VDN7 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rundc1Q0VDN7 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rundc1Q0VDN7 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rundc1Q0VDN7 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rundc1Q0VDN7 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rundc1Q0VDN7 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rundc1Q0VDN7 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rundc1Q0VDN7 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rundc1Q0VDN7 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rundc1Q0VDN7 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rundc1Q0VDN7 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rundc1Q0VDN7 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rundc1Q0VDN7 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rundc1Q0VDN7 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rundc1Q0VDN7 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rundc1Q0VDN7 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rundc1Q0VDN7 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rundc1Q0VDN7 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rundc1Q0VDN7 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rundc1Q0VDN7 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rundc1Q0VDN7 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rundc1Q0VDN7 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rundc1Q0VDN7 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rundc1Q0VDN7 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rundc1Q0VDN7 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rundc1Q0VDN7 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rundc1Q0VDN7 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rundc1Q0VDN7 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rundc1Q0VDN7 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rundc1Q0VDN7 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rundc1Q0VDN7 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rundc1Q0VDN7 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.2 ms