Protein–RNA interactions for Protein: Q0P678

Zc3h18, Zinc finger CCCH domain-containing protein 18, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 948 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zc3h18Q0P678 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zc3h18Q0P678 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Zc3h18Q0P678 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zc3h18Q0P678 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zc3h18Q0P678 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zc3h18Q0P678 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zc3h18Q0P678 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zc3h18Q0P678 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zc3h18Q0P678 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zc3h18Q0P678 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zc3h18Q0P678 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zc3h18Q0P678 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zc3h18Q0P678 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zc3h18Q0P678 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zc3h18Q0P678 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zc3h18Q0P678 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zc3h18Q0P678 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zc3h18Q0P678 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zc3h18Q0P678 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Zc3h18Q0P678 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zc3h18Q0P678 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zc3h18Q0P678 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zc3h18Q0P678 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zc3h18Q0P678 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zc3h18Q0P678 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zc3h18Q0P678 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zc3h18Q0P678 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zc3h18Q0P678 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zc3h18Q0P678 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zc3h18Q0P678 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zc3h18Q0P678 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zc3h18Q0P678 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zc3h18Q0P678 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zc3h18Q0P678 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zc3h18Q0P678 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zc3h18Q0P678 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zc3h18Q0P678 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zc3h18Q0P678 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zc3h18Q0P678 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zc3h18Q0P678 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zc3h18Q0P678 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zc3h18Q0P678 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zc3h18Q0P678 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zc3h18Q0P678 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zc3h18Q0P678 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zc3h18Q0P678 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zc3h18Q0P678 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zc3h18Q0P678 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zc3h18Q0P678 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zc3h18Q0P678 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zc3h18Q0P678 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zc3h18Q0P678 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zc3h18Q0P678 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zc3h18Q0P678 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zc3h18Q0P678 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Zc3h18Q0P678 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Zc3h18Q0P678 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Zc3h18Q0P678 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Zc3h18Q0P678 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Zc3h18Q0P678 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zc3h18Q0P678 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zc3h18Q0P678 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zc3h18Q0P678 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zc3h18Q0P678 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zc3h18Q0P678 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zc3h18Q0P678 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zc3h18Q0P678 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zc3h18Q0P678 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zc3h18Q0P678 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zc3h18Q0P678 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zc3h18Q0P678 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zc3h18Q0P678 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zc3h18Q0P678 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zc3h18Q0P678 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zc3h18Q0P678 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zc3h18Q0P678 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zc3h18Q0P678 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zc3h18Q0P678 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zc3h18Q0P678 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zc3h18Q0P678 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zc3h18Q0P678 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zc3h18Q0P678 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zc3h18Q0P678 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zc3h18Q0P678 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zc3h18Q0P678 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zc3h18Q0P678 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zc3h18Q0P678 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zc3h18Q0P678 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zc3h18Q0P678 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zc3h18Q0P678 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Zc3h18Q0P678 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zc3h18Q0P678 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zc3h18Q0P678 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zc3h18Q0P678 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zc3h18Q0P678 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zc3h18Q0P678 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zc3h18Q0P678 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zc3h18Q0P678 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zc3h18Q0P678 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zc3h18Q0P678 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms