Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ubxn2bQ0KL01 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ubxn2bQ0KL01 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ubxn2bQ0KL01 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Ubxn2bQ0KL01 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ubxn2bQ0KL01 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ubxn2bQ0KL01 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Ubxn2bQ0KL01 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ubxn2bQ0KL01 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Ubxn2bQ0KL01 Gm37419-201ENSMUST00000210705 114 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ubxn2bQ0KL01 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Ubxn2bQ0KL01 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ubxn2bQ0KL01 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ubxn2bQ0KL01 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ubxn2bQ0KL01 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ubxn2bQ0KL01 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ubxn2bQ0KL01 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ubxn2bQ0KL01 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ubxn2bQ0KL01 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ubxn2bQ0KL01 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ubxn2bQ0KL01 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Ubxn2bQ0KL01 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ubxn2bQ0KL01 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ubxn2bQ0KL01 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ubxn2bQ0KL01 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Ubxn2bQ0KL01 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ubxn2bQ0KL01 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ubxn2bQ0KL01 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ubxn2bQ0KL01 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ubxn2bQ0KL01 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Ubxn2bQ0KL01 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Ubxn2bQ0KL01 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ubxn2bQ0KL01 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ubxn2bQ0KL01 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Ubxn2bQ0KL01 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Ubxn2bQ0KL01 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ubxn2bQ0KL01 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ubxn2bQ0KL01 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ubxn2bQ0KL01 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ubxn2bQ0KL01 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ubxn2bQ0KL01 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ubxn2bQ0KL01 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ubxn2bQ0KL01 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ubxn2bQ0KL01 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Ubxn2bQ0KL01 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ubxn2bQ0KL01 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ubxn2bQ0KL01 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ubxn2bQ0KL01 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ubxn2bQ0KL01 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ubxn2bQ0KL01 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ubxn2bQ0KL01 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ubxn2bQ0KL01 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ubxn2bQ0KL01 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ubxn2bQ0KL01 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ubxn2bQ0KL01 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ubxn2bQ0KL01 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ubxn2bQ0KL01 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ubxn2bQ0KL01 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ubxn2bQ0KL01 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ubxn2bQ0KL01 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ubxn2bQ0KL01 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ubxn2bQ0KL01 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ubxn2bQ0KL01 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ubxn2bQ0KL01 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ubxn2bQ0KL01 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ubxn2bQ0KL01 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ubxn2bQ0KL01 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ubxn2bQ0KL01 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ubxn2bQ0KL01 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ubxn2bQ0KL01 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ubxn2bQ0KL01 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ubxn2bQ0KL01 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ubxn2bQ0KL01 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ubxn2bQ0KL01 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ubxn2bQ0KL01 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ubxn2bQ0KL01 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ubxn2bQ0KL01 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ubxn2bQ0KL01 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ubxn2bQ0KL01 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ubxn2bQ0KL01 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ubxn2bQ0KL01 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ubxn2bQ0KL01 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ubxn2bQ0KL01 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ubxn2bQ0KL01 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ubxn2bQ0KL01 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ubxn2bQ0KL01 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ubxn2bQ0KL01 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ubxn2bQ0KL01 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ubxn2bQ0KL01 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ubxn2bQ0KL01 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ubxn2bQ0KL01 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ubxn2bQ0KL01 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ubxn2bQ0KL01 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ubxn2bQ0KL01 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ubxn2bQ0KL01 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ubxn2bQ0KL01 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ubxn2bQ0KL01 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ubxn2bQ0KL01 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ubxn2bQ0KL01 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ubxn2bQ0KL01 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms