Protein–RNA interactions for Protein: Q0II04

Nebl, Nebulette, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NeblQ0II04 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NeblQ0II04 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NeblQ0II04 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NeblQ0II04 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NeblQ0II04 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NeblQ0II04 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NeblQ0II04 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NeblQ0II04 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NeblQ0II04 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NeblQ0II04 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NeblQ0II04 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NeblQ0II04 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NeblQ0II04 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NeblQ0II04 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
NeblQ0II04 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
NeblQ0II04 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NeblQ0II04 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NeblQ0II04 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
NeblQ0II04 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
NeblQ0II04 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
NeblQ0II04 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NeblQ0II04 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NeblQ0II04 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
NeblQ0II04 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NeblQ0II04 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NeblQ0II04 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NeblQ0II04 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NeblQ0II04 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NeblQ0II04 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NeblQ0II04 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NeblQ0II04 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NeblQ0II04 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NeblQ0II04 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NeblQ0II04 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NeblQ0II04 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NeblQ0II04 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NeblQ0II04 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NeblQ0II04 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NeblQ0II04 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NeblQ0II04 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NeblQ0II04 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NeblQ0II04 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NeblQ0II04 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
NeblQ0II04 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NeblQ0II04 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NeblQ0II04 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NeblQ0II04 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NeblQ0II04 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NeblQ0II04 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NeblQ0II04 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NeblQ0II04 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NeblQ0II04 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NeblQ0II04 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NeblQ0II04 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NeblQ0II04 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NeblQ0II04 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NeblQ0II04 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NeblQ0II04 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NeblQ0II04 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NeblQ0II04 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NeblQ0II04 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NeblQ0II04 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NeblQ0II04 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NeblQ0II04 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NeblQ0II04 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NeblQ0II04 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NeblQ0II04 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NeblQ0II04 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NeblQ0II04 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NeblQ0II04 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NeblQ0II04 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NeblQ0II04 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
NeblQ0II04 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
NeblQ0II04 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NeblQ0II04 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NeblQ0II04 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NeblQ0II04 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NeblQ0II04 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NeblQ0II04 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NeblQ0II04 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NeblQ0II04 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
NeblQ0II04 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NeblQ0II04 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NeblQ0II04 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NeblQ0II04 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NeblQ0II04 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
NeblQ0II04 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NeblQ0II04 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NeblQ0II04 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NeblQ0II04 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NeblQ0II04 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NeblQ0II04 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NeblQ0II04 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NeblQ0II04 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NeblQ0II04 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NeblQ0II04 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NeblQ0II04 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NeblQ0II04 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
NeblQ0II04 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NeblQ0II04 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms