Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

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Length 1,315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ttc21bQ0HA38 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ttc21bQ0HA38 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Ttc21bQ0HA38 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ttc21bQ0HA38 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ttc21bQ0HA38 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ttc21bQ0HA38 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ttc21bQ0HA38 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ttc21bQ0HA38 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ttc21bQ0HA38 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ttc21bQ0HA38 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ttc21bQ0HA38 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ttc21bQ0HA38 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ttc21bQ0HA38 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ttc21bQ0HA38 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ttc21bQ0HA38 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ttc21bQ0HA38 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Ttc21bQ0HA38 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Ttc21bQ0HA38 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ttc21bQ0HA38 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ttc21bQ0HA38 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ttc21bQ0HA38 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ttc21bQ0HA38 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ttc21bQ0HA38 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ttc21bQ0HA38 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ttc21bQ0HA38 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ttc21bQ0HA38 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ttc21bQ0HA38 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ttc21bQ0HA38 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ttc21bQ0HA38 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ttc21bQ0HA38 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ttc21bQ0HA38 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ttc21bQ0HA38 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ttc21bQ0HA38 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ttc21bQ0HA38 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Ttc21bQ0HA38 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ttc21bQ0HA38 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
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Ttc21bQ0HA38 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
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Ttc21bQ0HA38 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ttc21bQ0HA38 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ttc21bQ0HA38 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ttc21bQ0HA38 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
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Ttc21bQ0HA38 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
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Ttc21bQ0HA38 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ttc21bQ0HA38 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
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Ttc21bQ0HA38 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
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Ttc21bQ0HA38 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ttc21bQ0HA38 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
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Ttc21bQ0HA38 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ttc21bQ0HA38 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ttc21bQ0HA38 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ttc21bQ0HA38 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ttc21bQ0HA38 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ttc21bQ0HA38 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ttc21bQ0HA38 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ttc21bQ0HA38 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Ttc21bQ0HA38 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Ttc21bQ0HA38 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ttc21bQ0HA38 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ttc21bQ0HA38 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ttc21bQ0HA38 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ttc21bQ0HA38 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ttc21bQ0HA38 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ttc21bQ0HA38 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ttc21bQ0HA38 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ttc21bQ0HA38 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
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