Protein–RNA interactions for Protein: Q08943

Ssrp1, FACT complex subunit SSRP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssrp1Q08943 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ssrp1Q08943 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ssrp1Q08943 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ssrp1Q08943 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ssrp1Q08943 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ssrp1Q08943 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ssrp1Q08943 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ssrp1Q08943 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ssrp1Q08943 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ssrp1Q08943 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ssrp1Q08943 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ssrp1Q08943 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ssrp1Q08943 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ssrp1Q08943 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ssrp1Q08943 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ssrp1Q08943 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ssrp1Q08943 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ssrp1Q08943 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ssrp1Q08943 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ssrp1Q08943 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ssrp1Q08943 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ssrp1Q08943 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ssrp1Q08943 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ssrp1Q08943 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ssrp1Q08943 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ssrp1Q08943 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ssrp1Q08943 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ssrp1Q08943 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ssrp1Q08943 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ssrp1Q08943 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ssrp1Q08943 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ssrp1Q08943 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ssrp1Q08943 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ssrp1Q08943 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ssrp1Q08943 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ssrp1Q08943 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ssrp1Q08943 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ssrp1Q08943 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ssrp1Q08943 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ssrp1Q08943 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ssrp1Q08943 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ssrp1Q08943 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ssrp1Q08943 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ssrp1Q08943 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ssrp1Q08943 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ssrp1Q08943 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ssrp1Q08943 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ssrp1Q08943 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ssrp1Q08943 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ssrp1Q08943 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ssrp1Q08943 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ssrp1Q08943 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ssrp1Q08943 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ssrp1Q08943 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ssrp1Q08943 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ssrp1Q08943 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ssrp1Q08943 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ssrp1Q08943 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ssrp1Q08943 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ssrp1Q08943 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ssrp1Q08943 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ssrp1Q08943 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ssrp1Q08943 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ssrp1Q08943 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ssrp1Q08943 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ssrp1Q08943 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ssrp1Q08943 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ssrp1Q08943 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ssrp1Q08943 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ssrp1Q08943 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ssrp1Q08943 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ssrp1Q08943 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ssrp1Q08943 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ssrp1Q08943 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ssrp1Q08943 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ssrp1Q08943 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ssrp1Q08943 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ssrp1Q08943 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ssrp1Q08943 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ssrp1Q08943 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ssrp1Q08943 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ssrp1Q08943 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ssrp1Q08943 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ssrp1Q08943 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ssrp1Q08943 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ssrp1Q08943 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ssrp1Q08943 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ssrp1Q08943 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ssrp1Q08943 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ssrp1Q08943 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ssrp1Q08943 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ssrp1Q08943 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ssrp1Q08943 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ssrp1Q08943 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ssrp1Q08943 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ssrp1Q08943 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ssrp1Q08943 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ssrp1Q08943 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ssrp1Q08943 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ssrp1Q08943 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms