Protein–RNA interactions for Protein: Q07456

Ambp, Protein AMBP, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmbpQ07456 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
AmbpQ07456 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
AmbpQ07456 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
AmbpQ07456 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
AmbpQ07456 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
AmbpQ07456 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
AmbpQ07456 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
AmbpQ07456 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
AmbpQ07456 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
AmbpQ07456 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
AmbpQ07456 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
AmbpQ07456 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
AmbpQ07456 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
AmbpQ07456 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
AmbpQ07456 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
AmbpQ07456 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
AmbpQ07456 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
AmbpQ07456 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
AmbpQ07456 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
AmbpQ07456 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
AmbpQ07456 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
AmbpQ07456 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
AmbpQ07456 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
AmbpQ07456 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
AmbpQ07456 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
AmbpQ07456 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
AmbpQ07456 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
AmbpQ07456 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
AmbpQ07456 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
AmbpQ07456 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
AmbpQ07456 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
AmbpQ07456 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
AmbpQ07456 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
AmbpQ07456 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
AmbpQ07456 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
AmbpQ07456 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
AmbpQ07456 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
AmbpQ07456 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
AmbpQ07456 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
AmbpQ07456 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
AmbpQ07456 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
AmbpQ07456 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
AmbpQ07456 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
AmbpQ07456 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
AmbpQ07456 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
AmbpQ07456 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
AmbpQ07456 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
AmbpQ07456 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
AmbpQ07456 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
AmbpQ07456 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
AmbpQ07456 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
AmbpQ07456 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
AmbpQ07456 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
AmbpQ07456 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
AmbpQ07456 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
AmbpQ07456 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
AmbpQ07456 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
AmbpQ07456 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
AmbpQ07456 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
AmbpQ07456 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
AmbpQ07456 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
AmbpQ07456 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
AmbpQ07456 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
AmbpQ07456 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
AmbpQ07456 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
AmbpQ07456 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
AmbpQ07456 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
AmbpQ07456 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
AmbpQ07456 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
AmbpQ07456 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
AmbpQ07456 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
AmbpQ07456 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
AmbpQ07456 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
AmbpQ07456 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
AmbpQ07456 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
AmbpQ07456 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
AmbpQ07456 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
AmbpQ07456 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
AmbpQ07456 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
AmbpQ07456 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
AmbpQ07456 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
AmbpQ07456 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
AmbpQ07456 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
AmbpQ07456 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
AmbpQ07456 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
AmbpQ07456 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
AmbpQ07456 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
AmbpQ07456 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
AmbpQ07456 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
AmbpQ07456 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
AmbpQ07456 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
AmbpQ07456 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
AmbpQ07456 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
AmbpQ07456 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
AmbpQ07456 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
AmbpQ07456 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
AmbpQ07456 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
AmbpQ07456 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
AmbpQ07456 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
AmbpQ07456 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms