Protein–RNA interactions for Protein: Q06986

Siah2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah2Q06986 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Siah2Q06986 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Siah2Q06986 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Siah2Q06986 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Siah2Q06986 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Siah2Q06986 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Siah2Q06986 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Siah2Q06986 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
Siah2Q06986 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Siah2Q06986 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Siah2Q06986 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Siah2Q06986 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Siah2Q06986 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Siah2Q06986 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Siah2Q06986 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Siah2Q06986 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Siah2Q06986 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Siah2Q06986 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Siah2Q06986 1700065O20Rik-201ENSMUST00000186872 710 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Siah2Q06986 2810404M03Rik-201ENSMUST00000188324 1245 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Siah2Q06986 Gm43906-201ENSMUST00000203194 906 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Siah2Q06986 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Siah2Q06986 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Siah2Q06986 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Siah2Q06986 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Siah2Q06986 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Siah2Q06986 Olfr851-201ENSMUST00000064582 939 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Siah2Q06986 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Siah2Q06986 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Siah2Q06986 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Siah2Q06986 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Siah2Q06986 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Siah2Q06986 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Siah2Q06986 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Siah2Q06986 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Siah2Q06986 C730045M19Rik-201ENSMUST00000201944 1315 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Siah2Q06986 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Siah2Q06986 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Siah2Q06986 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Siah2Q06986 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Siah2Q06986 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Siah2Q06986 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Siah2Q06986 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Siah2Q06986 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Siah2Q06986 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Siah2Q06986 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Siah2Q06986 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Siah2Q06986 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Siah2Q06986 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Siah2Q06986 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Siah2Q06986 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Siah2Q06986 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Siah2Q06986 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Siah2Q06986 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Siah2Q06986 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Siah2Q06986 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Siah2Q06986 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Siah2Q06986 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Siah2Q06986 5330439A09Rik-201ENSMUST00000162770 1117 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Siah2Q06986 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Siah2Q06986 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Siah2Q06986 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Siah2Q06986 Gm43084-201ENSMUST00000200696 947 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Siah2Q06986 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Siah2Q06986 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Siah2Q06986 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Siah2Q06986 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Siah2Q06986 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Siah2Q06986 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Siah2Q06986 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Siah2Q06986 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Siah2Q06986 Vmn1r4-201ENSMUST00000096612 1034 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Siah2Q06986 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Siah2Q06986 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Siah2Q06986 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Siah2Q06986 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Siah2Q06986 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Siah2Q06986 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Siah2Q06986 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Siah2Q06986 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Siah2Q06986 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Siah2Q06986 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Siah2Q06986 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Siah2Q06986 Gm17540-201ENSMUST00000181617 1528 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Siah2Q06986 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Siah2Q06986 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Siah2Q06986 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Siah2Q06986 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Siah2Q06986 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Siah2Q06986 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Siah2Q06986 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Siah2Q06986 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Siah2Q06986 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Siah2Q06986 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Siah2Q06986 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Siah2Q06986 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Siah2Q06986 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Siah2Q06986 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Siah2Q06986 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Siah2Q06986 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68 ms