Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh3bp2Q06649 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh3bp2Q06649 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh3bp2Q06649 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh3bp2Q06649 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh3bp2Q06649 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh3bp2Q06649 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh3bp2Q06649 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh3bp2Q06649 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh3bp2Q06649 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh3bp2Q06649 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh3bp2Q06649 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh3bp2Q06649 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh3bp2Q06649 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh3bp2Q06649 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh3bp2Q06649 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh3bp2Q06649 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh3bp2Q06649 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sh3bp2Q06649 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sh3bp2Q06649 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sh3bp2Q06649 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sh3bp2Q06649 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sh3bp2Q06649 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sh3bp2Q06649 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sh3bp2Q06649 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sh3bp2Q06649 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sh3bp2Q06649 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sh3bp2Q06649 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sh3bp2Q06649 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sh3bp2Q06649 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sh3bp2Q06649 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sh3bp2Q06649 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sh3bp2Q06649 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sh3bp2Q06649 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sh3bp2Q06649 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sh3bp2Q06649 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sh3bp2Q06649 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sh3bp2Q06649 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sh3bp2Q06649 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sh3bp2Q06649 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sh3bp2Q06649 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sh3bp2Q06649 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sh3bp2Q06649 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sh3bp2Q06649 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sh3bp2Q06649 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sh3bp2Q06649 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sh3bp2Q06649 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sh3bp2Q06649 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sh3bp2Q06649 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sh3bp2Q06649 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh3bp2Q06649 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh3bp2Q06649 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh3bp2Q06649 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh3bp2Q06649 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh3bp2Q06649 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh3bp2Q06649 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh3bp2Q06649 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh3bp2Q06649 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh3bp2Q06649 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh3bp2Q06649 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh3bp2Q06649 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh3bp2Q06649 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh3bp2Q06649 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh3bp2Q06649 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh3bp2Q06649 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh3bp2Q06649 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh3bp2Q06649 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh3bp2Q06649 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh3bp2Q06649 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh3bp2Q06649 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh3bp2Q06649 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh3bp2Q06649 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh3bp2Q06649 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh3bp2Q06649 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh3bp2Q06649 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh3bp2Q06649 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh3bp2Q06649 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh3bp2Q06649 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh3bp2Q06649 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh3bp2Q06649 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh3bp2Q06649 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh3bp2Q06649 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh3bp2Q06649 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sh3bp2Q06649 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sh3bp2Q06649 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sh3bp2Q06649 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sh3bp2Q06649 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sh3bp2Q06649 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sh3bp2Q06649 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sh3bp2Q06649 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sh3bp2Q06649 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sh3bp2Q06649 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Sh3bp2Q06649 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sh3bp2Q06649 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sh3bp2Q06649 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sh3bp2Q06649 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Sh3bp2Q06649 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sh3bp2Q06649 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sh3bp2Q06649 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sh3bp2Q06649 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms