Protein–RNA interactions for Protein: Q05909

Ptprg, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, mousemouse

Predictions only

Length 1,442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprgQ05909 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PtprgQ05909 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PtprgQ05909 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PtprgQ05909 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PtprgQ05909 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PtprgQ05909 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PtprgQ05909 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PtprgQ05909 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PtprgQ05909 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PtprgQ05909 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PtprgQ05909 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PtprgQ05909 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PtprgQ05909 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PtprgQ05909 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PtprgQ05909 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PtprgQ05909 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PtprgQ05909 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PtprgQ05909 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PtprgQ05909 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PtprgQ05909 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PtprgQ05909 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PtprgQ05909 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PtprgQ05909 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PtprgQ05909 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PtprgQ05909 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PtprgQ05909 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PtprgQ05909 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PtprgQ05909 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PtprgQ05909 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PtprgQ05909 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PtprgQ05909 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PtprgQ05909 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PtprgQ05909 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PtprgQ05909 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PtprgQ05909 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PtprgQ05909 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PtprgQ05909 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PtprgQ05909 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PtprgQ05909 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PtprgQ05909 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PtprgQ05909 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PtprgQ05909 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PtprgQ05909 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PtprgQ05909 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PtprgQ05909 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PtprgQ05909 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PtprgQ05909 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PtprgQ05909 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PtprgQ05909 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PtprgQ05909 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PtprgQ05909 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PtprgQ05909 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PtprgQ05909 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PtprgQ05909 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PtprgQ05909 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PtprgQ05909 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PtprgQ05909 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PtprgQ05909 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PtprgQ05909 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PtprgQ05909 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PtprgQ05909 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PtprgQ05909 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PtprgQ05909 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PtprgQ05909 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PtprgQ05909 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PtprgQ05909 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PtprgQ05909 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PtprgQ05909 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PtprgQ05909 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PtprgQ05909 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PtprgQ05909 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PtprgQ05909 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PtprgQ05909 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PtprgQ05909 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PtprgQ05909 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PtprgQ05909 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PtprgQ05909 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PtprgQ05909 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PtprgQ05909 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PtprgQ05909 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PtprgQ05909 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PtprgQ05909 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PtprgQ05909 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PtprgQ05909 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PtprgQ05909 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PtprgQ05909 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PtprgQ05909 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PtprgQ05909 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PtprgQ05909 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PtprgQ05909 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PtprgQ05909 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PtprgQ05909 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PtprgQ05909 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PtprgQ05909 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PtprgQ05909 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PtprgQ05909 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PtprgQ05909 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PtprgQ05909 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PtprgQ05909 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PtprgQ05909 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms