Protein–RNA interactions for Protein: Q04750

Top1, DNA topoisomerase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1Q04750 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Top1Q04750 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Top1Q04750 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Top1Q04750 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Top1Q04750 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Top1Q04750 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Top1Q04750 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Top1Q04750 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Top1Q04750 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Top1Q04750 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Top1Q04750 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Top1Q04750 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Top1Q04750 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Top1Q04750 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Top1Q04750 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Top1Q04750 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Top1Q04750 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Top1Q04750 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Top1Q04750 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Top1Q04750 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Top1Q04750 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Top1Q04750 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Top1Q04750 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Top1Q04750 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Top1Q04750 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Top1Q04750 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Top1Q04750 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Top1Q04750 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Top1Q04750 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Top1Q04750 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Top1Q04750 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Top1Q04750 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Top1Q04750 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Top1Q04750 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Top1Q04750 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Top1Q04750 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Top1Q04750 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Top1Q04750 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Top1Q04750 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Top1Q04750 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Top1Q04750 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Top1Q04750 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Top1Q04750 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Top1Q04750 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Top1Q04750 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Top1Q04750 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Top1Q04750 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Top1Q04750 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Top1Q04750 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Top1Q04750 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Top1Q04750 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Top1Q04750 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Top1Q04750 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Top1Q04750 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Top1Q04750 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Top1Q04750 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Top1Q04750 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Top1Q04750 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Top1Q04750 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Top1Q04750 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Top1Q04750 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Top1Q04750 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Top1Q04750 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Top1Q04750 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Top1Q04750 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Top1Q04750 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Top1Q04750 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Top1Q04750 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Top1Q04750 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Top1Q04750 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Top1Q04750 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Top1Q04750 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Top1Q04750 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Top1Q04750 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Top1Q04750 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Top1Q04750 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Top1Q04750 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Top1Q04750 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Top1Q04750 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Top1Q04750 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Top1Q04750 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Top1Q04750 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Top1Q04750 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Top1Q04750 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Top1Q04750 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Top1Q04750 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Top1Q04750 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Top1Q04750 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Top1Q04750 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Top1Q04750 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Top1Q04750 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Top1Q04750 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Top1Q04750 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Top1Q04750 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Top1Q04750 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Top1Q04750 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Top1Q04750 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Top1Q04750 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Top1Q04750 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Top1Q04750 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms