Protein–RNA interactions for Protein: Q04744

Emx2, Homeobox protein EMX2, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emx2Q04744 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Emx2Q04744 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Emx2Q04744 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Emx2Q04744 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Emx2Q04744 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Emx2Q04744 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Emx2Q04744 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Emx2Q04744 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Emx2Q04744 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Emx2Q04744 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Emx2Q04744 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Emx2Q04744 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Emx2Q04744 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Emx2Q04744 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Emx2Q04744 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Emx2Q04744 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Emx2Q04744 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Emx2Q04744 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Emx2Q04744 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Emx2Q04744 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Emx2Q04744 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Emx2Q04744 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Emx2Q04744 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Emx2Q04744 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Emx2Q04744 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Emx2Q04744 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Emx2Q04744 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Emx2Q04744 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Emx2Q04744 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Emx2Q04744 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Emx2Q04744 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Emx2Q04744 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Emx2Q04744 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Emx2Q04744 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Emx2Q04744 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Emx2Q04744 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Emx2Q04744 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Emx2Q04744 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Emx2Q04744 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Emx2Q04744 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Emx2Q04744 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Emx2Q04744 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Emx2Q04744 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Emx2Q04744 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Emx2Q04744 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Emx2Q04744 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Emx2Q04744 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Emx2Q04744 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Emx2Q04744 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Emx2Q04744 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Emx2Q04744 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Emx2Q04744 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Emx2Q04744 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Emx2Q04744 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Emx2Q04744 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Emx2Q04744 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Emx2Q04744 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Emx2Q04744 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Emx2Q04744 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Emx2Q04744 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Emx2Q04744 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Emx2Q04744 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Emx2Q04744 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Emx2Q04744 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Emx2Q04744 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Emx2Q04744 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Emx2Q04744 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Emx2Q04744 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Emx2Q04744 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Emx2Q04744 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Emx2Q04744 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Emx2Q04744 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Emx2Q04744 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Emx2Q04744 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Emx2Q04744 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Emx2Q04744 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Emx2Q04744 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Emx2Q04744 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Emx2Q04744 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Emx2Q04744 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Emx2Q04744 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Emx2Q04744 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Emx2Q04744 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Emx2Q04744 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Emx2Q04744 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Emx2Q04744 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Emx2Q04744 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Emx2Q04744 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Emx2Q04744 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Emx2Q04744 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Emx2Q04744 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Emx2Q04744 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Emx2Q04744 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Emx2Q04744 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Emx2Q04744 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Emx2Q04744 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Emx2Q04744 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Emx2Q04744 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Emx2Q04744 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Emx2Q04744 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms