Protein–RNA interactions for Protein: Q03958

Pfdn6, Prefoldin subunit 6, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn6Q03958 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Pfdn6Q03958 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pfdn6Q03958 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pfdn6Q03958 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pfdn6Q03958 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Pfdn6Q03958 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Pfdn6Q03958 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pfdn6Q03958 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Pfdn6Q03958 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pfdn6Q03958 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pfdn6Q03958 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pfdn6Q03958 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pfdn6Q03958 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pfdn6Q03958 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pfdn6Q03958 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pfdn6Q03958 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pfdn6Q03958 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pfdn6Q03958 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Pfdn6Q03958 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Pfdn6Q03958 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pfdn6Q03958 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pfdn6Q03958 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Pfdn6Q03958 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pfdn6Q03958 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pfdn6Q03958 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Pfdn6Q03958 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pfdn6Q03958 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Pfdn6Q03958 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pfdn6Q03958 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pfdn6Q03958 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pfdn6Q03958 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pfdn6Q03958 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pfdn6Q03958 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pfdn6Q03958 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pfdn6Q03958 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pfdn6Q03958 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pfdn6Q03958 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pfdn6Q03958 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pfdn6Q03958 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pfdn6Q03958 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pfdn6Q03958 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pfdn6Q03958 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Pfdn6Q03958 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pfdn6Q03958 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Pfdn6Q03958 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pfdn6Q03958 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pfdn6Q03958 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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