Protein–RNA interactions for Protein: Q03719

Kcnd1, Potassium voltage-gated channel subfamily D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 651 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnd1Q03719 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnd1Q03719 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnd1Q03719 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnd1Q03719 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnd1Q03719 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnd1Q03719 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnd1Q03719 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnd1Q03719 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnd1Q03719 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnd1Q03719 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnd1Q03719 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnd1Q03719 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnd1Q03719 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnd1Q03719 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnd1Q03719 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnd1Q03719 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnd1Q03719 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnd1Q03719 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnd1Q03719 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnd1Q03719 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnd1Q03719 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnd1Q03719 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnd1Q03719 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnd1Q03719 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kcnd1Q03719 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kcnd1Q03719 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kcnd1Q03719 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kcnd1Q03719 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kcnd1Q03719 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kcnd1Q03719 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kcnd1Q03719 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kcnd1Q03719 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kcnd1Q03719 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kcnd1Q03719 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kcnd1Q03719 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kcnd1Q03719 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kcnd1Q03719 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kcnd1Q03719 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Kcnd1Q03719 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Kcnd1Q03719 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Kcnd1Q03719 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Kcnd1Q03719 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Kcnd1Q03719 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Kcnd1Q03719 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Kcnd1Q03719 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Kcnd1Q03719 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Kcnd1Q03719 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Kcnd1Q03719 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Kcnd1Q03719 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Kcnd1Q03719 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Kcnd1Q03719 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Kcnd1Q03719 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Kcnd1Q03719 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnd1Q03719 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnd1Q03719 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnd1Q03719 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnd1Q03719 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnd1Q03719 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnd1Q03719 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnd1Q03719 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnd1Q03719 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnd1Q03719 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnd1Q03719 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnd1Q03719 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnd1Q03719 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnd1Q03719 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnd1Q03719 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnd1Q03719 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnd1Q03719 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnd1Q03719 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnd1Q03719 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnd1Q03719 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnd1Q03719 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnd1Q03719 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnd1Q03719 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnd1Q03719 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnd1Q03719 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnd1Q03719 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnd1Q03719 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnd1Q03719 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnd1Q03719 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnd1Q03719 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnd1Q03719 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnd1Q03719 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnd1Q03719 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnd1Q03719 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnd1Q03719 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnd1Q03719 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnd1Q03719 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnd1Q03719 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnd1Q03719 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnd1Q03719 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnd1Q03719 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnd1Q03719 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnd1Q03719 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnd1Q03719 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnd1Q03719 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnd1Q03719 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnd1Q03719 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnd1Q03719 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms