Protein–RNA interactions for Protein: Q03404

Tff2, Trefoil factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff2Q03404 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tff2Q03404 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tff2Q03404 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tff2Q03404 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tff2Q03404 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tff2Q03404 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tff2Q03404 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tff2Q03404 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tff2Q03404 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tff2Q03404 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tff2Q03404 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tff2Q03404 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tff2Q03404 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tff2Q03404 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tff2Q03404 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tff2Q03404 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tff2Q03404 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tff2Q03404 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tff2Q03404 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tff2Q03404 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tff2Q03404 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tff2Q03404 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tff2Q03404 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tff2Q03404 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tff2Q03404 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tff2Q03404 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tff2Q03404 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tff2Q03404 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tff2Q03404 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tff2Q03404 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tff2Q03404 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tff2Q03404 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tff2Q03404 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tff2Q03404 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tff2Q03404 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tff2Q03404 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tff2Q03404 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tff2Q03404 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tff2Q03404 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tff2Q03404 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tff2Q03404 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tff2Q03404 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tff2Q03404 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tff2Q03404 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tff2Q03404 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tff2Q03404 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tff2Q03404 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tff2Q03404 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tff2Q03404 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tff2Q03404 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tff2Q03404 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tff2Q03404 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tff2Q03404 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tff2Q03404 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tff2Q03404 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tff2Q03404 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tff2Q03404 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tff2Q03404 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tff2Q03404 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tff2Q03404 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tff2Q03404 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tff2Q03404 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tff2Q03404 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tff2Q03404 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tff2Q03404 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tff2Q03404 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tff2Q03404 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tff2Q03404 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tff2Q03404 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tff2Q03404 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tff2Q03404 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tff2Q03404 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tff2Q03404 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tff2Q03404 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tff2Q03404 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tff2Q03404 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tff2Q03404 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tff2Q03404 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tff2Q03404 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tff2Q03404 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tff2Q03404 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tff2Q03404 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tff2Q03404 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tff2Q03404 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tff2Q03404 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tff2Q03404 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tff2Q03404 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tff2Q03404 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tff2Q03404 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tff2Q03404 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tff2Q03404 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tff2Q03404 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tff2Q03404 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tff2Q03404 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tff2Q03404 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tff2Q03404 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tff2Q03404 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tff2Q03404 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tff2Q03404 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tff2Q03404 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms