Protein–RNA interactions for Protein: Q03366

Ccl7, C-C motif chemokine 7, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl7Q03366 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccl7Q03366 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccl7Q03366 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccl7Q03366 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccl7Q03366 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccl7Q03366 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccl7Q03366 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccl7Q03366 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccl7Q03366 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccl7Q03366 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccl7Q03366 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccl7Q03366 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccl7Q03366 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccl7Q03366 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccl7Q03366 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccl7Q03366 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccl7Q03366 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccl7Q03366 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccl7Q03366 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccl7Q03366 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccl7Q03366 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccl7Q03366 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccl7Q03366 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccl7Q03366 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccl7Q03366 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccl7Q03366 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccl7Q03366 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccl7Q03366 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccl7Q03366 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccl7Q03366 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccl7Q03366 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccl7Q03366 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccl7Q03366 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccl7Q03366 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccl7Q03366 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccl7Q03366 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccl7Q03366 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccl7Q03366 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccl7Q03366 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccl7Q03366 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccl7Q03366 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccl7Q03366 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccl7Q03366 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccl7Q03366 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccl7Q03366 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccl7Q03366 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccl7Q03366 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccl7Q03366 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccl7Q03366 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccl7Q03366 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccl7Q03366 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccl7Q03366 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccl7Q03366 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccl7Q03366 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccl7Q03366 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccl7Q03366 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccl7Q03366 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccl7Q03366 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccl7Q03366 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccl7Q03366 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccl7Q03366 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccl7Q03366 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccl7Q03366 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccl7Q03366 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccl7Q03366 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccl7Q03366 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccl7Q03366 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccl7Q03366 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccl7Q03366 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccl7Q03366 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccl7Q03366 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccl7Q03366 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccl7Q03366 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccl7Q03366 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccl7Q03366 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccl7Q03366 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccl7Q03366 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccl7Q03366 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccl7Q03366 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccl7Q03366 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccl7Q03366 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccl7Q03366 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccl7Q03366 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccl7Q03366 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccl7Q03366 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccl7Q03366 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccl7Q03366 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccl7Q03366 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccl7Q03366 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccl7Q03366 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccl7Q03366 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccl7Q03366 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccl7Q03366 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccl7Q03366 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccl7Q03366 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccl7Q03366 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccl7Q03366 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccl7Q03366 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccl7Q03366 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccl7Q03366 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.9 ms