Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Msx2Q03358 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Msx2Q03358 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Msx2Q03358 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Msx2Q03358 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Msx2Q03358 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Msx2Q03358 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms