Protein–RNA interactions for Protein: Q01853

Vcp, Transitional endoplasmic reticulum ATPase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VcpQ01853 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
VcpQ01853 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
VcpQ01853 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
VcpQ01853 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VcpQ01853 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VcpQ01853 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VcpQ01853 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VcpQ01853 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
VcpQ01853 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VcpQ01853 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VcpQ01853 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VcpQ01853 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
VcpQ01853 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
VcpQ01853 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VcpQ01853 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VcpQ01853 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
VcpQ01853 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VcpQ01853 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
VcpQ01853 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
VcpQ01853 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VcpQ01853 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
VcpQ01853 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VcpQ01853 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VcpQ01853 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
VcpQ01853 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VcpQ01853 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VcpQ01853 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
VcpQ01853 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VcpQ01853 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VcpQ01853 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
VcpQ01853 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VcpQ01853 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VcpQ01853 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
VcpQ01853 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VcpQ01853 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VcpQ01853 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
VcpQ01853 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
VcpQ01853 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
VcpQ01853 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
VcpQ01853 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VcpQ01853 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VcpQ01853 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VcpQ01853 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
VcpQ01853 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
VcpQ01853 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
VcpQ01853 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VcpQ01853 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
VcpQ01853 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VcpQ01853 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
VcpQ01853 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VcpQ01853 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VcpQ01853 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
VcpQ01853 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
VcpQ01853 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VcpQ01853 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VcpQ01853 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
VcpQ01853 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
VcpQ01853 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
VcpQ01853 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
VcpQ01853 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VcpQ01853 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
VcpQ01853 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VcpQ01853 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VcpQ01853 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
VcpQ01853 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VcpQ01853 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VcpQ01853 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VcpQ01853 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VcpQ01853 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VcpQ01853 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
VcpQ01853 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
VcpQ01853 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
VcpQ01853 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VcpQ01853 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VcpQ01853 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
VcpQ01853 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VcpQ01853 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VcpQ01853 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VcpQ01853 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
VcpQ01853 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VcpQ01853 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VcpQ01853 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VcpQ01853 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VcpQ01853 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
VcpQ01853 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
VcpQ01853 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VcpQ01853 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
VcpQ01853 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
VcpQ01853 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
VcpQ01853 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
VcpQ01853 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VcpQ01853 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VcpQ01853 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
VcpQ01853 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VcpQ01853 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VcpQ01853 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VcpQ01853 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VcpQ01853 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VcpQ01853 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VcpQ01853 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms