Protein–RNA interactions for Protein: Q01098

Grin2c, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2cQ01098 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Grin2cQ01098 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Grin2cQ01098 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Grin2cQ01098 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Grin2cQ01098 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Grin2cQ01098 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Grin2cQ01098 AC073947.1-201ENSMUST00000216991 649 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Grin2cQ01098 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Grin2cQ01098 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Grin2cQ01098 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Grin2cQ01098 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Grin2cQ01098 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Grin2cQ01098 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Grin2cQ01098 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Grin2cQ01098 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Grin2cQ01098 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Grin2cQ01098 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Grin2cQ01098 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Grin2cQ01098 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Grin2cQ01098 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Grin2cQ01098 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Grin2cQ01098 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Grin2cQ01098 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Grin2cQ01098 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Grin2cQ01098 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Grin2cQ01098 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Grin2cQ01098 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Grin2cQ01098 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Grin2cQ01098 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Grin2cQ01098 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Grin2cQ01098 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Grin2cQ01098 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Grin2cQ01098 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Grin2cQ01098 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Grin2cQ01098 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Grin2cQ01098 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Grin2cQ01098 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Grin2cQ01098 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Grin2cQ01098 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Grin2cQ01098 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Grin2cQ01098 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Grin2cQ01098 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Grin2cQ01098 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Grin2cQ01098 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Grin2cQ01098 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Grin2cQ01098 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Grin2cQ01098 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Grin2cQ01098 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Grin2cQ01098 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Grin2cQ01098 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Grin2cQ01098 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Grin2cQ01098 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Grin2cQ01098 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Grin2cQ01098 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Grin2cQ01098 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Grin2cQ01098 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Grin2cQ01098 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Grin2cQ01098 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Grin2cQ01098 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Grin2cQ01098 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Grin2cQ01098 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Grin2cQ01098 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Grin2cQ01098 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Grin2cQ01098 Gm37083-201ENSMUST00000195784 711 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Grin2cQ01098 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Grin2cQ01098 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Grin2cQ01098 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Grin2cQ01098 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Grin2cQ01098 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Grin2cQ01098 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Grin2cQ01098 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Grin2cQ01098 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Grin2cQ01098 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Grin2cQ01098 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Grin2cQ01098 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Grin2cQ01098 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Grin2cQ01098 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Grin2cQ01098 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Grin2cQ01098 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Grin2cQ01098 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Grin2cQ01098 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Grin2cQ01098 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Grin2cQ01098 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Grin2cQ01098 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Grin2cQ01098 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Grin2cQ01098 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Grin2cQ01098 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Grin2cQ01098 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Grin2cQ01098 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Grin2cQ01098 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Grin2cQ01098 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Grin2cQ01098 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Grin2cQ01098 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Grin2cQ01098 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Grin2cQ01098 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Grin2cQ01098 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Grin2cQ01098 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Grin2cQ01098 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Grin2cQ01098 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Grin2cQ01098 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms