Protein–RNA interactions for Protein: Q00724

Rbp4, Retinol-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp4Q00724 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rbp4Q00724 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rbp4Q00724 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rbp4Q00724 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rbp4Q00724 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rbp4Q00724 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rbp4Q00724 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Rbp4Q00724 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rbp4Q00724 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rbp4Q00724 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rbp4Q00724 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rbp4Q00724 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rbp4Q00724 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Rbp4Q00724 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Rbp4Q00724 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Rbp4Q00724 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rbp4Q00724 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rbp4Q00724 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rbp4Q00724 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rbp4Q00724 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rbp4Q00724 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rbp4Q00724 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rbp4Q00724 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rbp4Q00724 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rbp4Q00724 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rbp4Q00724 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rbp4Q00724 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rbp4Q00724 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rbp4Q00724 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rbp4Q00724 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rbp4Q00724 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rbp4Q00724 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rbp4Q00724 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rbp4Q00724 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rbp4Q00724 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rbp4Q00724 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rbp4Q00724 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rbp4Q00724 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rbp4Q00724 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rbp4Q00724 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rbp4Q00724 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rbp4Q00724 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rbp4Q00724 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rbp4Q00724 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rbp4Q00724 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rbp4Q00724 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rbp4Q00724 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rbp4Q00724 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rbp4Q00724 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rbp4Q00724 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Rbp4Q00724 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Rbp4Q00724 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Rbp4Q00724 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rbp4Q00724 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rbp4Q00724 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Rbp4Q00724 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rbp4Q00724 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rbp4Q00724 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rbp4Q00724 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rbp4Q00724 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rbp4Q00724 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rbp4Q00724 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rbp4Q00724 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rbp4Q00724 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rbp4Q00724 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rbp4Q00724 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rbp4Q00724 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rbp4Q00724 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rbp4Q00724 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rbp4Q00724 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rbp4Q00724 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rbp4Q00724 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rbp4Q00724 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Rbp4Q00724 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Rbp4Q00724 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Rbp4Q00724 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Rbp4Q00724 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms