Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Itga4Q00651 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Itga4Q00651 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Itga4Q00651 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Itga4Q00651 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Itga4Q00651 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itga4Q00651 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itga4Q00651 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itga4Q00651 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itga4Q00651 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itga4Q00651 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Itga4Q00651 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itga4Q00651 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itga4Q00651 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itga4Q00651 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itga4Q00651 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Itga4Q00651 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itga4Q00651 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Itga4Q00651 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Itga4Q00651 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itga4Q00651 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Itga4Q00651 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Itga4Q00651 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itga4Q00651 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itga4Q00651 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Itga4Q00651 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Itga4Q00651 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itga4Q00651 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itga4Q00651 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itga4Q00651 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itga4Q00651 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itga4Q00651 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itga4Q00651 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itga4Q00651 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itga4Q00651 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Itga4Q00651 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Itga4Q00651 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itga4Q00651 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itga4Q00651 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Itga4Q00651 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itga4Q00651 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Itga4Q00651 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itga4Q00651 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itga4Q00651 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itga4Q00651 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Itga4Q00651 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itga4Q00651 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Itga4Q00651 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itga4Q00651 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itga4Q00651 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Itga4Q00651 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Itga4Q00651 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Itga4Q00651 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Itga4Q00651 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itga4Q00651 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Itga4Q00651 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Itga4Q00651 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Itga4Q00651 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Itga4Q00651 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Itga4Q00651 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Itga4Q00651 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itga4Q00651 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itga4Q00651 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itga4Q00651 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Itga4Q00651 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itga4Q00651 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itga4Q00651 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itga4Q00651 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itga4Q00651 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itga4Q00651 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itga4Q00651 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Itga4Q00651 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Itga4Q00651 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Itga4Q00651 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Itga4Q00651 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Itga4Q00651 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Itga4Q00651 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Itga4Q00651 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Itga4Q00651 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Itga4Q00651 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Itga4Q00651 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Itga4Q00651 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Itga4Q00651 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Itga4Q00651 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Itga4Q00651 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Itga4Q00651 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Itga4Q00651 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Itga4Q00651 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Itga4Q00651 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Itga4Q00651 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Itga4Q00651 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Itga4Q00651 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Itga4Q00651 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Itga4Q00651 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Itga4Q00651 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Itga4Q00651 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Itga4Q00651 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Itga4Q00651 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Itga4Q00651 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Itga4Q00651 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms