Protein–RNA interactions for Protein: Q00558

F8a1, Factor VIII intron 22 protein, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8a1Q00558 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
F8a1Q00558 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
F8a1Q00558 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
F8a1Q00558 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
F8a1Q00558 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
F8a1Q00558 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
F8a1Q00558 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
F8a1Q00558 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
F8a1Q00558 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
F8a1Q00558 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
F8a1Q00558 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
F8a1Q00558 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
F8a1Q00558 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
F8a1Q00558 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
F8a1Q00558 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
F8a1Q00558 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
F8a1Q00558 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
F8a1Q00558 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
F8a1Q00558 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
F8a1Q00558 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
F8a1Q00558 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
F8a1Q00558 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
F8a1Q00558 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
F8a1Q00558 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
F8a1Q00558 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
F8a1Q00558 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
F8a1Q00558 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
F8a1Q00558 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
F8a1Q00558 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
F8a1Q00558 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
F8a1Q00558 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
F8a1Q00558 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
F8a1Q00558 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
F8a1Q00558 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
F8a1Q00558 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
F8a1Q00558 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
F8a1Q00558 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
F8a1Q00558 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
F8a1Q00558 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
F8a1Q00558 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
F8a1Q00558 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
F8a1Q00558 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
F8a1Q00558 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
F8a1Q00558 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
F8a1Q00558 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
F8a1Q00558 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
F8a1Q00558 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
F8a1Q00558 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
F8a1Q00558 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
F8a1Q00558 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
F8a1Q00558 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
F8a1Q00558 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
F8a1Q00558 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
F8a1Q00558 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
F8a1Q00558 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
F8a1Q00558 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
F8a1Q00558 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
F8a1Q00558 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
F8a1Q00558 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
F8a1Q00558 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
F8a1Q00558 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
F8a1Q00558 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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F8a1Q00558 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
F8a1Q00558 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
F8a1Q00558 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
F8a1Q00558 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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F8a1Q00558 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
F8a1Q00558 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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F8a1Q00558 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
F8a1Q00558 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
F8a1Q00558 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
F8a1Q00558 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
F8a1Q00558 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
F8a1Q00558 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
F8a1Q00558 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
F8a1Q00558 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
F8a1Q00558 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
F8a1Q00558 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
F8a1Q00558 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
F8a1Q00558 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
F8a1Q00558 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
F8a1Q00558 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
F8a1Q00558 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
F8a1Q00558 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
F8a1Q00558 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
F8a1Q00558 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
F8a1Q00558 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
F8a1Q00558 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
F8a1Q00558 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
F8a1Q00558 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
F8a1Q00558 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
F8a1Q00558 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
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