Protein–RNA interactions for Protein: P97762

rp9, Retinitis pigmentosa 9 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
rp9P97762 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
rp9P97762 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
rp9P97762 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
rp9P97762 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
rp9P97762 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
rp9P97762 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
rp9P97762 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
rp9P97762 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
rp9P97762 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
rp9P97762 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
rp9P97762 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
rp9P97762 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
rp9P97762 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
rp9P97762 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
rp9P97762 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
rp9P97762 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
rp9P97762 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
rp9P97762 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
rp9P97762 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
rp9P97762 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
rp9P97762 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
rp9P97762 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
rp9P97762 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
rp9P97762 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
rp9P97762 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
rp9P97762 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
rp9P97762 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
rp9P97762 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
rp9P97762 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
rp9P97762 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
rp9P97762 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
rp9P97762 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
rp9P97762 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
rp9P97762 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
rp9P97762 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
rp9P97762 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
rp9P97762 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
rp9P97762 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
rp9P97762 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
rp9P97762 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
rp9P97762 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
rp9P97762 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
rp9P97762 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
rp9P97762 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
rp9P97762 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
rp9P97762 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
rp9P97762 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
rp9P97762 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
rp9P97762 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
rp9P97762 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
rp9P97762 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
rp9P97762 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
rp9P97762 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
rp9P97762 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
rp9P97762 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
rp9P97762 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
rp9P97762 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
rp9P97762 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
rp9P97762 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
rp9P97762 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
rp9P97762 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
rp9P97762 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
rp9P97762 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
rp9P97762 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
rp9P97762 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
rp9P97762 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
rp9P97762 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
rp9P97762 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
rp9P97762 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
rp9P97762 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
rp9P97762 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
rp9P97762 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
rp9P97762 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
rp9P97762 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
rp9P97762 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
rp9P97762 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
rp9P97762 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
rp9P97762 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
rp9P97762 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
rp9P97762 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
rp9P97762 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
rp9P97762 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
rp9P97762 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
rp9P97762 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
rp9P97762 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
rp9P97762 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
rp9P97762 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
rp9P97762 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
rp9P97762 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
rp9P97762 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
rp9P97762 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
rp9P97762 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
rp9P97762 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
rp9P97762 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
rp9P97762 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
rp9P97762 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
rp9P97762 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
rp9P97762 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
rp9P97762 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
rp9P97762 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms