Protein–RNA interactions for Protein: P86448

Trim43b, Tripartite motif-containing protein 43B, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim43bP86448 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim43bP86448 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim43bP86448 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim43bP86448 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim43bP86448 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim43bP86448 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim43bP86448 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim43bP86448 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim43bP86448 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim43bP86448 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim43bP86448 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim43bP86448 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim43bP86448 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim43bP86448 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim43bP86448 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim43bP86448 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim43bP86448 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim43bP86448 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim43bP86448 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim43bP86448 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim43bP86448 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim43bP86448 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim43bP86448 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim43bP86448 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim43bP86448 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim43bP86448 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim43bP86448 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim43bP86448 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim43bP86448 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim43bP86448 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim43bP86448 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim43bP86448 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim43bP86448 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim43bP86448 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim43bP86448 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim43bP86448 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim43bP86448 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim43bP86448 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim43bP86448 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim43bP86448 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim43bP86448 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim43bP86448 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim43bP86448 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim43bP86448 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim43bP86448 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim43bP86448 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim43bP86448 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim43bP86448 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim43bP86448 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim43bP86448 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim43bP86448 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim43bP86448 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim43bP86448 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim43bP86448 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim43bP86448 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim43bP86448 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim43bP86448 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim43bP86448 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim43bP86448 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim43bP86448 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim43bP86448 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim43bP86448 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim43bP86448 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim43bP86448 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim43bP86448 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim43bP86448 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim43bP86448 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim43bP86448 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim43bP86448 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim43bP86448 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim43bP86448 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim43bP86448 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim43bP86448 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim43bP86448 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim43bP86448 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim43bP86448 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim43bP86448 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim43bP86448 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim43bP86448 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim43bP86448 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim43bP86448 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim43bP86448 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim43bP86448 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim43bP86448 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim43bP86448 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim43bP86448 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim43bP86448 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim43bP86448 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim43bP86448 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim43bP86448 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim43bP86448 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim43bP86448 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim43bP86448 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim43bP86448 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim43bP86448 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim43bP86448 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim43bP86448 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim43bP86448 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim43bP86448 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim43bP86448 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms