Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Irx3P81067 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Irx3P81067 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Irx3P81067 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Irx3P81067 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Irx3P81067 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Irx3P81067 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Irx3P81067 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Irx3P81067 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Irx3P81067 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Irx3P81067 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Irx3P81067 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Irx3P81067 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Irx3P81067 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Irx3P81067 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Irx3P81067 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Irx3P81067 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Irx3P81067 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Irx3P81067 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Irx3P81067 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Irx3P81067 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Irx3P81067 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Irx3P81067 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Irx3P81067 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Irx3P81067 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Irx3P81067 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Irx3P81067 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Irx3P81067 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Irx3P81067 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Irx3P81067 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Irx3P81067 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Irx3P81067 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Irx3P81067 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Irx3P81067 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Irx3P81067 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Irx3P81067 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Irx3P81067 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Irx3P81067 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Irx3P81067 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Irx3P81067 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Irx3P81067 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Irx3P81067 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Irx3P81067 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Irx3P81067 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Irx3P81067 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Irx3P81067 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Irx3P81067 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Irx3P81067 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Irx3P81067 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Irx3P81067 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Irx3P81067 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Irx3P81067 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Irx3P81067 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Irx3P81067 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Irx3P81067 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Irx3P81067 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Irx3P81067 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Irx3P81067 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Irx3P81067 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Irx3P81067 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Irx3P81067 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Irx3P81067 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Irx3P81067 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Irx3P81067 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Irx3P81067 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Irx3P81067 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Irx3P81067 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Irx3P81067 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Irx3P81067 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Irx3P81067 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Irx3P81067 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Irx3P81067 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Irx3P81067 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Irx3P81067 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Irx3P81067 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Irx3P81067 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Irx3P81067 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Irx3P81067 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Irx3P81067 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Irx3P81067 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Irx3P81067 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Irx3P81067 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Irx3P81067 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Irx3P81067 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Irx3P81067 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Irx3P81067 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Irx3P81067 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Irx3P81067 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Irx3P81067 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Irx3P81067 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Irx3P81067 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Irx3P81067 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Irx3P81067 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Irx3P81067 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Irx3P81067 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Irx3P81067 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Irx3P81067 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Irx3P81067 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Irx3P81067 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Irx3P81067 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms