Protein–RNA interactions for Protein: P80560

Ptprn2, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase N2, mousemouse

Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprn2P80560 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Ptprn2P80560 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptprn2P80560 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Ptprn2P80560 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptprn2P80560 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptprn2P80560 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Ptprn2P80560 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Ptprn2P80560 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Ptprn2P80560 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Ptprn2P80560 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ptprn2P80560 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Ptprn2P80560 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Ptprn2P80560 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptprn2P80560 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Ptprn2P80560 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptprn2P80560 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptprn2P80560 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptprn2P80560 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptprn2P80560 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptprn2P80560 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptprn2P80560 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptprn2P80560 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptprn2P80560 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptprn2P80560 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptprn2P80560 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptprn2P80560 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptprn2P80560 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
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Ptprn2P80560 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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