Protein–RNA interactions for Protein: P70399

Tp53bp1, TP53-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53bp1P70399 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tp53bp1P70399 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Tp53bp1P70399 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tp53bp1P70399 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tp53bp1P70399 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tp53bp1P70399 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tp53bp1P70399 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tp53bp1P70399 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tp53bp1P70399 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tp53bp1P70399 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tp53bp1P70399 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tp53bp1P70399 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tp53bp1P70399 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tp53bp1P70399 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tp53bp1P70399 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tp53bp1P70399 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tp53bp1P70399 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tp53bp1P70399 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tp53bp1P70399 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tp53bp1P70399 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tp53bp1P70399 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tp53bp1P70399 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tp53bp1P70399 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Tp53bp1P70399 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tp53bp1P70399 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Tp53bp1P70399 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tp53bp1P70399 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tp53bp1P70399 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tp53bp1P70399 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tp53bp1P70399 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Tp53bp1P70399 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tp53bp1P70399 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tp53bp1P70399 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tp53bp1P70399 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tp53bp1P70399 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tp53bp1P70399 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tp53bp1P70399 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tp53bp1P70399 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tp53bp1P70399 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
Tp53bp1P70399 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Tp53bp1P70399 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Tp53bp1P70399 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tp53bp1P70399 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tp53bp1P70399 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tp53bp1P70399 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Tp53bp1P70399 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ 0
Tp53bp1P70399 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tp53bp1P70399 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Tp53bp1P70399 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tp53bp1P70399 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tp53bp1P70399 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tp53bp1P70399 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tp53bp1P70399 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tp53bp1P70399 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tp53bp1P70399 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tp53bp1P70399 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tp53bp1P70399 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tp53bp1P70399 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tp53bp1P70399 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tp53bp1P70399 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tp53bp1P70399 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tp53bp1P70399 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tp53bp1P70399 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Tp53bp1P70399 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tp53bp1P70399 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tp53bp1P70399 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tp53bp1P70399 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tp53bp1P70399 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tp53bp1P70399 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Tp53bp1P70399 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tp53bp1P70399 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tp53bp1P70399 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tp53bp1P70399 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tp53bp1P70399 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tp53bp1P70399 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tp53bp1P70399 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tp53bp1P70399 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tp53bp1P70399 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tp53bp1P70399 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tp53bp1P70399 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tp53bp1P70399 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tp53bp1P70399 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tp53bp1P70399 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tp53bp1P70399 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tp53bp1P70399 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tp53bp1P70399 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tp53bp1P70399 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tp53bp1P70399 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tp53bp1P70399 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tp53bp1P70399 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tp53bp1P70399 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tp53bp1P70399 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tp53bp1P70399 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tp53bp1P70399 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tp53bp1P70399 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tp53bp1P70399 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tp53bp1P70399 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tp53bp1P70399 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tp53bp1P70399 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tp53bp1P70399 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms