Protein–RNA interactions for Protein: P70354

Msx3, Homeobox protein MSX-3, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx3P70354 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Msx3P70354 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Msx3P70354 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Msx3P70354 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Msx3P70354 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Msx3P70354 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Msx3P70354 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Msx3P70354 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Msx3P70354 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Msx3P70354 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Msx3P70354 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Msx3P70354 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Msx3P70354 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Msx3P70354 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Msx3P70354 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Msx3P70354 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Msx3P70354 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Msx3P70354 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Msx3P70354 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Msx3P70354 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Msx3P70354 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Msx3P70354 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msx3P70354 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msx3P70354 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msx3P70354 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msx3P70354 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msx3P70354 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msx3P70354 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msx3P70354 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msx3P70354 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msx3P70354 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msx3P70354 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msx3P70354 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msx3P70354 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msx3P70354 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msx3P70354 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Msx3P70354 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msx3P70354 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msx3P70354 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msx3P70354 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msx3P70354 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msx3P70354 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msx3P70354 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Msx3P70354 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msx3P70354 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msx3P70354 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msx3P70354 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msx3P70354 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msx3P70354 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msx3P70354 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msx3P70354 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msx3P70354 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msx3P70354 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msx3P70354 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msx3P70354 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msx3P70354 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msx3P70354 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msx3P70354 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msx3P70354 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msx3P70354 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msx3P70354 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msx3P70354 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msx3P70354 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msx3P70354 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msx3P70354 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msx3P70354 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msx3P70354 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msx3P70354 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msx3P70354 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msx3P70354 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msx3P70354 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msx3P70354 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msx3P70354 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msx3P70354 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msx3P70354 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msx3P70354 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Msx3P70354 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Msx3P70354 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msx3P70354 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msx3P70354 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msx3P70354 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msx3P70354 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msx3P70354 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msx3P70354 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msx3P70354 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msx3P70354 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msx3P70354 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msx3P70354 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msx3P70354 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msx3P70354 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msx3P70354 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msx3P70354 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msx3P70354 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msx3P70354 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msx3P70354 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msx3P70354 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Msx3P70354 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Msx3P70354 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Msx3P70354 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Msx3P70354 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.2 ms