Protein–RNA interactions for Protein: P70339

Frat1, Proto-oncogene FRAT1, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frat1P70339 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Frat1P70339 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Frat1P70339 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Frat1P70339 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Frat1P70339 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Frat1P70339 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Frat1P70339 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Frat1P70339 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Frat1P70339 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Frat1P70339 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Frat1P70339 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Frat1P70339 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Frat1P70339 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Frat1P70339 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Frat1P70339 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Frat1P70339 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Frat1P70339 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Frat1P70339 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Frat1P70339 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Frat1P70339 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Frat1P70339 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Frat1P70339 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Frat1P70339 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Frat1P70339 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Frat1P70339 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Frat1P70339 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Frat1P70339 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Frat1P70339 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Frat1P70339 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Frat1P70339 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Frat1P70339 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Frat1P70339 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Frat1P70339 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Frat1P70339 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Frat1P70339 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Frat1P70339 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Frat1P70339 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Frat1P70339 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Frat1P70339 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Frat1P70339 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Frat1P70339 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Frat1P70339 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Frat1P70339 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Frat1P70339 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Frat1P70339 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Frat1P70339 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Frat1P70339 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Frat1P70339 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Frat1P70339 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Frat1P70339 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Frat1P70339 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Frat1P70339 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Frat1P70339 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Frat1P70339 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Frat1P70339 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Frat1P70339 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Frat1P70339 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Frat1P70339 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Frat1P70339 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Frat1P70339 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Frat1P70339 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Frat1P70339 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Frat1P70339 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Frat1P70339 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Frat1P70339 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Frat1P70339 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Frat1P70339 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Frat1P70339 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Frat1P70339 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Frat1P70339 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Frat1P70339 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Frat1P70339 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Frat1P70339 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Frat1P70339 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Frat1P70339 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Frat1P70339 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Frat1P70339 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Frat1P70339 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Frat1P70339 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Frat1P70339 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Frat1P70339 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Frat1P70339 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Frat1P70339 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Frat1P70339 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Frat1P70339 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Frat1P70339 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Frat1P70339 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Frat1P70339 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Frat1P70339 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Frat1P70339 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Frat1P70339 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Frat1P70339 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Frat1P70339 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Frat1P70339 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Frat1P70339 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Frat1P70339 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Frat1P70339 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Frat1P70339 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Frat1P70339 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Frat1P70339 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms